| 唾液腺腺样囊性癌中相关微小RNAs及其靶基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘发煇,侯婉云,梁家东,徐晶晶,罗春英.唾液腺腺样囊性癌中相关微小RNAs及其靶基因的生物信息学分析[J].解剖学报,2021,52(4):601-608. |
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| 作者姓名： | 刘发煇 侯婉云 梁家东 徐晶晶 罗春英 |
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| 作者单位： | 1.右江民族医学院附属医院病理科，广西 百色 533000; 2.右江民族医学院附属医院病理诊断与研究中心，广西 百色 533000 |
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| 基金项目： | 2015年度广西高校重点实验室开放课题;广西医疗卫生适宜技术开发与推广应用项目;百色市科技计划课题 |
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| 摘 要： | 目的 探讨唾液腺腺样囊性癌(SACC)潜在的微小RNAs(miRNAs）分子标志物，构建miRNA-mRNA调控网络，并阐明其潜在的分子机制。 方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载2个SACC的微阵列芯片数据，通过R语言进行分析差异的miRNAs与mRNA。应用FunRich 3.1.3软件对差异miRNA进行转录因子富集分析以及预测差异miRNAs的靶基因。对SACC中差异miRNAs的靶基因进行基因本体论（GO）富集分析与京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析以及蛋白互作分析。使用Cytoscape 3.7.0构建miRNA-mRNA调控网络。 结果 1. 共筛选出144个差异表达的miRNAs (DEMs)和1216个差异表达的mRNAs(DEGs)；2. KEGG信号通路富集分析发现，靶基因主要参与Rap1信号通路、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B（PI3K/Akt）信号通路以及肌动蛋白细胞骨架的调节；3. STRING蛋白相互作用分析发现，ACSL1、SCD、MGLL、FABP4在蛋白相互作用网络中处于核心地位。 结论 我们筛选出SACC与相对正常组织间差异明显的miRNA和mRNA，并分析发现了这些差异分子主要参与的信号通路和功能。
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| 关 键 词： | 唾液腺腺样囊性癌 微小RNA 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2020-06-17 |
| 修稿时间： | 2020-08-03 |
Bioinformatics analysis of the microRNAs and target genes of microRNAs in salivary adenoid cystic carcinoma |
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| LIU Fa-hui,HOU Wan-yun,LIANG Jia-dong,XU Jing-jing,LUO Chun-ying.Bioinformatics analysis of the microRNAs and target genes of microRNAs in salivary adenoid cystic carcinoma[J].Acta Anatomica Sinica,2021,52(4):601-608. |
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| Authors: | LIU Fa-hui HOU Wan-yun LIANG Jia-dong XU Jing-jing LUO Chun-ying |
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| Institution: | 1.Department of Pathology, the Affiliated Hospital of Youjiang Medical University of Nationalities, Guangxi Baise 533000, China; 2. Clinical Pathological Diagnosis and Research Centra, Youjiang Medical University of Nationalities, Guangxi Baise 533000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Salivary adenoid cystic carcinoma MicroRNA Bioinformatics |
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