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广州地区丙型肝炎患者HCV基因分型研究
引用本文:肖桂娥,魏绍静,张复春,陈伟烈,兰芸,饶嫒,钟剑波.广州地区丙型肝炎患者HCV基因分型研究[J].热带医学杂志,2014(5):589-594,598.
作者姓名:肖桂娥  魏绍静  张复春  陈伟烈  兰芸  饶嫒  钟剑波
作者单位:[1]广州医科大学附属广州市第八人民医院,广东广州510060 [2]广州市第八人民医院传染病研究所,广东广州510060
基金项目:广州市科技局基金(2011J4300092)
摘    要:目的研究广州地区丙型肝炎患者HCV基因型分布的变化情况。方法收集207例HCV RAN阳性丙型肝炎患者血清,对其HCV Core区(C区)和NS5B区基因序列进行RT-nPCR扩增,两区扩增成功的PCR产物进行基因测序,测序结果分别与相应的参照株序列比对,构建系统进化树,两区基因分型结果一致者确定HCV基因亚型。结果 185例HCV C区和NS5B区都扩增成功,其中179例两区基因分型结果一致。共检出1、2、3、6型4种基因型和8种基因亚型,其中1b型占40.78%(73/179),6a型占27.37%(49/179),3b型占11.73%(21/179),3a型占8.94%(16/179),2a型占6.15%(11/179),1a型占3.91%(7/179),2b型占0.56%(1/179),6n型占0.56%(1/179)。1b株可分为A、B、C三大簇,A簇与中国广泛流行1b株接近、B簇与中国中部及南部地区流行1b株接近,6a株分为Ⅰ、Ⅱ两大簇,与献血人群及静脉吸毒人群中6a型株接近。结论广州地区丙型肝炎患者HCV基因型以1b、6a、3型为主,存在多种亚型;1b型株包含中国大部分地区的1b型株,6a、3型已取代2a型分别成为第二、三主要流行基因型;未发现6型变异株。

关 键 词:丙型肝炎病毒  基因型  C区  NS5B区  进化树

Genotypes of hepatitis C virus in hepatitis C patients in Guangzhou area
XIAO Gui-e,WEI Shao-jing,ZHANG Fu-chun,CHEN Wei-lie,LAN Yun,RAO Man,ZHONG Jian-bo.Genotypes of hepatitis C virus in hepatitis C patients in Guangzhou area[J].Journal Of Tropical Medicine,2014(5):589-594,598.
Authors:XIAO Gui-e  WEI Shao-jing  ZHANG Fu-chun  CHEN Wei-lie  LAN Yun  RAO Man  ZHONG Jian-bo
Institution:1. The 8th Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University, Guangdong, Guangzhou 510060; 2. Institute of lnfectious Diseases of the 8th Hospital of Guangzhou, Guangdong, Guangzhou 510060, China)
Abstract:
Keywords:hepatitis C virus  genotype  C region  NS5B region  phylogeny
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