| 基于转录组测序的脓毒症小鼠脾脏差异表达基因分析 |
| |
| 引用本文： | 卢礼悦,雍玥,高浩,李利利,宋建钢. 基于转录组测序的脓毒症小鼠脾脏差异表达基因分析[J]. 中国中西医结合外科杂志, 2022, 28(4): 531-537 |
| |
| 作者姓名： | 卢礼悦 雍玥 高浩 李利利 宋建钢 |
| |
| 作者单位： | 上海中医药大学附属曙光医院麻醉科上海 201203 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(81774108);上海市卫健委科研课题计划(201940062) |
| |
| 摘 要： | 目的:研究脂多糖(LPS)诱导的脓毒症小鼠脾脏中mRNA表达变化及特征,寻找影响脓毒症病理生理进程的信号通路。方法:将50只小鼠分成LPS组和Sham组,每组25只,比较两组小鼠存活率及血清中肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-6和IL-1β水平。提取脾脏中mRNA,利用转录组测序技术测定基因表达量,随后通过两种富集方法分析:寻找差异表达基因(P< 0.05, |log2FoldChange| ≥1)进行GO和KEGG分析以及在GSEA v4.0.1软件中富集P < 0.05,Q < 0.25的基因。RT-qPCR验证10个显著差异表达基因。结果: LPS成功构建脓毒症模型,表现出严重炎症反应和高死亡率。LPS组对比Sham组显著改变的差异表达基因有1 616个,其中下调基因919个,上调基因697个。富集分析涉及多条炎症反应、调控遗传信息、参与信号转导和细胞过程的通路。RT-qPCR验证结果显示10个基因表达趋势与测序结果一致。结论:胞质DNA传感途径可能在脓毒症病理过程中起着重要作用,Zbp1、Ddx58、Cxcl10、Polr1d可能是其发挥功能的重要靶点。
|
| 关 键 词： | 脓毒症 转录组测序 mRNA 基因表达 |
| 收稿时间： | 2021-11-28 |
Analysis of Differentially Expressed Genes in the Spleen of Sepsis Mice Based on RNA-Seq |
| |
| LU Liyue,YONG Yue,GAO Hao. Analysis of Differentially Expressed Genes in the Spleen of Sepsis Mice Based on RNA-Seq[J]. Chinese Journal of Surgery of Integrated Traditional and Western Medicine, 2022, 28(4): 531-537 |
| |
| Authors: | LU Liyue YONG Yue GAO Hao |
| |
| Affiliation: | Department of Anesthesiology, Shuguang Hospital Affiliated to Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 201203, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | sepsis transcriptome sequencing mRNA gene expression |
|
| 点击此处可从《中国中西医结合外科杂志》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《中国中西医结合外科杂志》下载免费的PDF全文 |
|
