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基于网络药理学及斑马鱼模型的瓜蒌薤白半夏汤干预慢性阻塞性肺疾病的作用机制研究
引用本文:谈晓莹,李丹,刘培,冯伟萌,武文星,刘嘉庆,宿树兰,郭盛,尚尔鑫,张黄琴,段金廒. 基于网络药理学及斑马鱼模型的瓜蒌薤白半夏汤干预慢性阻塞性肺疾病的作用机制研究[J]. 中草药, 2021, 52(17): 5233-5243
作者姓名:谈晓莹  李丹  刘培  冯伟萌  武文星  刘嘉庆  宿树兰  郭盛  尚尔鑫  张黄琴  段金廒
作者单位:南京中医药大学 江苏省方剂高技术研究重点实验室, 江苏省方剂研究重点实验室, 江苏省中药资源产业化过程协同创新中心, 中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心, 江苏南京 210023
基金项目:江苏省自然科学基金面上项目(BK20201403);江苏省高校自然科学基金重大项目(19KJA320002);江苏省第十六批“六大人才高峰”计划(JNHB-066);江苏省青蓝工程项目;江苏省高等学校大学生创新创业训练计划项目(202010315047Y)
摘    要:目的基于网络药理学方法和斑马鱼模型探讨瓜蒌薤白半夏汤干预慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmoriary disease,COPD)的潜在作用机制。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药百科全书数据库(ETCM)、中医药综合数据库(TCMID)以及国内外相关文献检索瓜蒌薤白半夏汤的主要活性成分,通过TCMSP和SwissTargetPrediction数据库预测靶点;通过GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和TCMSP数据库获取COPD相关靶点,并采用交集法筛选出与瓜蒌薤白半夏汤活性成分作用的共同靶点。运用Cytoscape 3.7.1软件构建"中药-活性成分-靶点"网络,通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;通过DAVID数据库对共有基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;借助斑马鱼炎症模型对筛选的靶点进行实验验证。结果瓜蒌薤白半夏汤共筛选出成分955个,潜在活性成分106个,核心活性成分如芹菜素、茴香酸、美迪紫檀素、金圣草黄素、香叶木素等74个,对应靶点1134个;PPI网络分析获得瓜蒌薤白半夏汤干预COPD的关键作用靶点408个,包括碳酸酐酶9(carbonic anhydrase 9,CA9)、前列腺素内过氧化物合酶1(prostaglandin-endoperoxide synthase 1,PTGS1)、胰岛素(insulin,INS)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(serine/threonine protein kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、MAPK3、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)等;GO功能及KEGG通路富集分析得出与瓜蒌半夏薤白汤干预COPD作用相关的生物过程1096个,如炎症反应、细胞溶质、酶结合等;相关信号通路125条,如癌症通路、TNF信号通路、前列腺癌、缺氧诱导因子1信号通路、神经活性配体-受体相互作用等。斑马鱼炎症模型实验结果显示,瓜蒌薤白半夏汤显著降低IL-6、B淋巴细胞2(B-cell lymphoma 2,BCL2)和EGFR mRNA表达水平(P0.05),降低半胱氨酸蛋白酶8(Caspases 8,CASP8)m RNA表达水平。结论瓜蒌薤白半夏汤可能通过作用于EGFR、IL-6、BCL2、CASP8等靶点,调节多条信号通路,从而发挥对COPD的治疗作用。

关 键 词:瓜蒌薤白半夏汤  慢性阻塞性肺疾病  网络药理学  斑马鱼模型  EGFR  IL-6  BCL2  CASP8
收稿时间:2021-05-12

Mechanism of Gualou Xiebai Banxia Decoction on chronic obstructive pulmonary disease based on network pharmacology and zebrafish model
TAN Xiao-ying,LI Dan,LIU Pei,FENG Wei-meng,WU Wen-xing,LIU Jia-qing,SU Shu-lan,GUO Sheng,SHANG Er-xin,ZHANG Huang-qin,DUAN Jin-ao. Mechanism of Gualou Xiebai Banxia Decoction on chronic obstructive pulmonary disease based on network pharmacology and zebrafish model[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2021, 52(17): 5233-5243
Authors:TAN Xiao-ying  LI Dan  LIU Pei  FENG Wei-meng  WU Wen-xing  LIU Jia-qing  SU Shu-lan  GUO Sheng  SHANG Er-xin  ZHANG Huang-qin  DUAN Jin-ao
Affiliation:Jiangsu Key Laboratory for High Technology Research of TCM Formulae, Jiangsu Key Laboratory of TCM Formulae, Jiangsu Collaborative Innovation Center of Chinese Medicinal Resources Industrialization, National and Local Collaborative Engineering Center of Chinese Medicinal Resources Industrialization and Formulae Innovative Medicine, Nanjing University of Chinese Medicine, Nanjing 210023, China
Abstract:
Keywords:Gualou Xiebai Banxia Decoction  chronic obstructive pulmonary disease  network pharmacology  zebrafish model  EGFR  IL-6  BCL2  CASP8
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