| 湖北省HIV-1 B′亚型核心蛋白基因序列分析 |
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| 引用本文： | 陈慧萍,褚小刚,詹发先,汤恒,彭国平,戴涌,彭庭海,龚作炯.湖北省HIV-1 B′亚型核心蛋白基因序列分析[J].中国公共卫生,2008,24(12). |
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| 作者姓名： | 陈慧萍 褚小刚 詹发先 汤恒 彭国平 戴涌 彭庭海 龚作炯 |
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| 作者单位： | 1. 湖北省疾病预防控制中心性病艾滋病防治中心,武汉,430079
2. 武汉大学人民医院感染科病毒学国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 湖北省卫生厅科研基金重点项目 |
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| 摘 要： | 目的 分析湖北省人类免疫缺陷病毒(HIV-1)主要流行株核心蛋白(gag)基因P17/24区序列特征,了解其流行特点和变异规律.方法 对湖北省HIV-1主要流行区域进行流行病学调查,应用巢式聚合酶链反应对102例HIV-1感染者的gag基因P17/24区进行扩增,对阳性扩增样本进行基因测序和序列分析.结果 湖北省共发现4种HIV亚型和重组亚型,B'亚型占82.69%,B'/C重组毒株、CRF01-AE重组毒株各占7.69%,C亚型占1.92%;基因序列分析显示,湖北省HIV-1 B'亚型与我国河南和云南省等地的毒株有较高的同源性;氨基酸序列变异分析显示,HIV-1 B'亚型毒株gag基因P17/24区发生不同程度的变异,P17突变位点较多,P24较为保守.结论 B'亚型依然是湖北省HIV优势流行株,HIV-1在湖北省有加快流行和进一步复杂化的趋势.
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| 关 键 词： | 人类免疫缺陷病毒(HIV-1) 亚型 gag基因 基因变异 |
Sequence variation in gag P17/24 region of HIV type 1 predominant subtype B strains circulating in Hubei province |
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| CHEN Hui-ping,CHU Xiao-gang,ZHAN Fa-xian,et al..Sequence variation in gag P17/24 region of HIV type 1 predominant subtype B strains circulating in Hubei province[J].Chinese Journal of Public Health,2008,24(12). |
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| Authors: | CHEN Hui-ping CHU Xiao-gang ZHAN Fa-xian |
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| Institution: | CHEN Hui-ping,CHU Xiao-gang,ZHAN Fa-xian,et al.Hubei Provincial Center for Disease Control , Prevention(Wuhan 430079,China) |
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| Abstract: | Objective To study the genetic characteristic and amino acid mutations of HIV-1 and to identify the subtypes and infection sources and the trends of infection of human immunodeficiency virus 1(HIV-1)predominant circulating strains in Hubei province.Methods Epidemiologic survey was done among HIV-1 carriers found in Hubei area.HIV-1 gag P17/24 region were amplified by nested-polymerase chain reaction(nPCR).The sequences were determined,and then phylogenetic analysis was performed.Results Four HIV-1 strains o... |
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| Keywords: | HIV-1 subtype gag gene genetics variation |
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