| A3/A1复合物对接及结构域之间相互作用的分子动力学研究 |
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| 引用本文： | 李圆圆,宁志龙,吴建华,方颖. A3/A1复合物对接及结构域之间相互作用的分子动力学研究[J]. 医用生物力学, 2020, 35(2): 195-201 |
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| 作者姓名： | 李圆圆 宁志龙 吴建华 方颖 |
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| 作者单位： | 华南理工大学 生物科学与工程学院,华南理工大学 生物科学与工程学院,华南理工大学 生物科学与工程学院,华南理工大学 生物科学与工程学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（11672109，11432006，11272125，31170887） |
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| 摘 要： | 目的探究血管性血友病因子(von Willbrand factor,v WF) A1、A3结构域间的相互作用及A3的2 M型突变W1745C对A3/A1热稳定性和机械稳定性的影响。方法 A1、A3的晶体结构取自PDB数据库,首先通过柔性对接获得WT-A3/A1(野生型)复合物结构;再利用计算机突变技术构建W1745C-A3/A1复合物体系;最后采用拉伸分子动力学模拟,观察接触面氢键和盐桥的形成与演化,对比分析WT-A3/A1与W1745C-A3/A1在复合物构象、解离力和解离时间的差异。结果 WT-A3/A1接触面之间存在5对生存率大于0. 2的氢键和1对生存率大于0. 5的盐桥; W1745C-A3突变提高了结合面氢键的生存率并增加1对稳定盐桥,从而能够抵抗更大的拉伸力,延缓A1/A3的解离。结论 v WF分子内部A1与A3的相互作用阻碍A1与血小板的结合,而W1745C-A3突变则强化这种分子内部的相互作用,降低A1对血小板的亲和力。研究结果为深入揭示临床中突变导致的血管性血友病的分子机制及相应药物研制提供参考。
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| 关 键 词： | 血管性血友病因子； 分子动力学模拟； 柔性对接； 机械稳定性 |
| 收稿时间： | 2019-03-26 |
| 修稿时间： | 2019-04-24 |
Molecular Dynamics Study on Docking of A3/A1 and Interdomain Interactions |
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| LI Yuanyuan,NING Zhilong,WU Jianhu,FANG Ying. Molecular Dynamics Study on Docking of A3/A1 and Interdomain Interactions[J]. Journal of Medical Biomechanics, 2020, 35(2): 195-201 |
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| Authors: | LI Yuanyuan NING Zhilong WU Jianhu FANG Ying |
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| Affiliation: | School of Bioscience and Bioengineering, South China University of Technology,School of Bioscience and Bioengineering, South China University of Technology,School of Bioscience and Bioengineering, South China University of Technology and School of Bioscience and Bioengineering, South China University of Technology |
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