计算机模拟法探讨没药治疗骨肉瘤的作用机制 |
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引用本文: | 杨燕妮,勾伟颖,段辛威,李西海,陈友琴,马德尊,叶锦霞,付长龙,郑春松.计算机模拟法探讨没药治疗骨肉瘤的作用机制[J].福建中医药,2023(1):48-56. |
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作者姓名: | 杨燕妮 勾伟颖 段辛威 李西海 陈友琴 马德尊 叶锦霞 付长龙 郑春松 |
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作者单位: | 1. 福建中医药大学药学院;2. 福建中医药大学中西医结合研究院;3. 福建中医药大学中西医结合学院;4. 美国凯斯西储大学医学院;5. 福建省中西医结合老年性疾病重点实验室 |
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基金项目: | 福建省自然科学基金项目(2022J01877); |
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摘 要: | 目的 探讨没药治疗骨肉瘤(OS)的作用及其机制。方法 以口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18为阈值,从中药系统药理学数据库及分析平台,收集没药的潜在活性成分及其对应靶点,并通过中国知网数据库检索与骨肉瘤相关的已报道活性化合物,利用Discovery Studio(DS)模拟软件,分别构建没药潜在活性成分和已报道活性化合物的数据集,基于“Calculate Molecular Properties”模块,比较两数据集的化学空间;以已知活性化合物数据集为参照配体,基于“Find Similar Moleculars by Fingerprints”模块,从没药潜在活性成分数据集中找出相似的分子。在GEO、OMIM、PharmGkb、DrugBank与GeneCards数据库中收集OS疾病靶点,与没药成分对应靶点取交集,将交集靶点与活性成分导入Cytoscape 3.8.1软件中,构建没药活性成分-靶点网络;再将交集靶点导入STRING网站构建蛋白质-蛋白质作用网络(PPI网络),在Cytoscape 3.8.1软件中拓扑分析筛选出核心靶点;用DAVID在线数据库对交集靶点进行基因本体(...
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关 键 词: | 没药 骨肉瘤 化学空间 网络药理学 分子对接 |
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