基于TCGA数据分析UHRF1在低级别胶质瘤中的表达与预后 |
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引用本文: | 郭兆刚,岳博,霍云龙,祖静,邓超,万妍.基于TCGA数据分析UHRF1在低级别胶质瘤中的表达与预后[J].解剖科学进展,2022(5):610-613. |
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作者姓名: | 郭兆刚 岳博 霍云龙 祖静 邓超 万妍 |
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作者单位: | 1. 武警辽宁省总队医院神经外科;2. 中国医科大学附属盛京医院病理科;3. 武警辽宁省总队医院经管科;4. 北部战区总医院麻醉科 |
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基金项目: | 辽宁省科学技术基金(2021JH2/10300065); |
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摘 要: | 目的 探究泛素样含PHD和环指域蛋白1(UHRF1)在低级别胶质瘤中表达水平及与患者预后之间的联系。方法 从TCGA数据库中下载提取低级别胶质瘤样本和在GTEx数据库中的正常脑组织样本的转录组数据合并后分析UHRF1的表达水平;分析比较UHRF1表达水平高低不同的低级别胶质瘤患者组的预后区别;GSEA富集分析UHRF1在低级别胶质瘤中主要参与的信号通路;通过TIMER数据库分析低级别胶质瘤组织中UHRF1表达与常见的免疫细胞浸润的相关性;选取6例低级别胶质瘤组织及3例非癌脑组织,通过RT-qPCR的方法验证UHRF1在低级别胶质瘤与非癌脑组织的表达情况。结果 UHRF1在低级别胶质瘤组织中的表达量明显高于非癌脑组织,且UHRF1表达水平高的患者在预后相对更差(P<0.01);富集分析显示,UHRF1可能通过MYC_TARGETS_V2通路在低级别胶质瘤中发挥作用;在低级别胶质瘤组织中,UHRF1的表达与巨噬细胞呈正相关(P<0.01);在收集到的病例中,与非癌脑组织相比,UHRF1在低级别胶质瘤中的表达显著增高(P<0.001)。结论 UHRF1在胶质瘤中高表达且有着...
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关 键 词: | 低级别胶质瘤 UHRF1 TCGA 预后 |
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