| 款冬叶不同发育阶段的转录组学分析 |
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| 引用本文： | 聂佳慧,张福生,田栋,郭冬,雷振宏,秦雪梅,李震宇. 款冬叶不同发育阶段的转录组学分析[J]. 中草药, 2018, 49(13): 3095-3101 |
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| 作者姓名： | 聂佳慧 张福生 田栋 郭冬 雷振宏 秦雪梅 李震宇 |
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| 作者单位： | 山西大学中医药现代研究中心;山西大学化学化工学院;山西振东集团 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（31270008）；国家中药标准化项目（ZYBZH-Y-JIN-34）；山西省科技创新重点团队（201605D131045-18）；地产中药功效物质研究与利用山西省重点实验室（201605D111004） |
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| 摘 要： | 目的比较不同生长时期款冬叶中苯丙素类成分生物合成相关基因的表达,推测苯丙素类成分的最佳合成积累时期,为款冬叶资源的合理利用提供科学依据。方法利用Illumina Hi Seq2500测序技术对不同时期的款冬叶进行转录组测序,获得转录组数据后进行基因功能注释等生物信息学分析,对苯丙素类生物合成相关基因在不同时期的表达进行比较。结果通过转录组测序技术获得46 793个Unigenes,平均长度为952.144 8 bp,其中有4 774个可以被NR、Swiss-Prot、eggNOG、GO、KEGG等公共数据库共同注释。对注释得到的Unigenes进行KEGG代谢通路分析,结果显示款冬叶转录组中有144条Unigenes参与萜类、黄酮类和苯丙素类生物合成,其中萜类65条,苯丙素类64条,黄酮类15条。进一步对参与苯丙素类生物合成相关基因进行动态比较,发现其关键酶PAL、4CL、HCT、CCoAOMT等在9月的表达量最高,即苯丙素类成分在9月的生物合成量可能最高。结论为苯丙素类成分的生物合成途径及调控分析奠定了基础,也为款冬叶资源的开发利用奠定了科学依据。
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| 关 键 词： | 款冬 转录组 功能基因 代谢通路 苯丙素类化合物 |
| 收稿时间： | 2018-04-09 |
Comparative transcriptomic analysis of leaves of Tussilago farfara in different development stages |
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| NIE Jia-hui,ZHANG Fu-sheng,TIAN Dong,GUO Dong,LEI Zhen-hong,QIN Xue-mei and LI Zhen-yu. Comparative transcriptomic analysis of leaves of Tussilago farfara in different development stages[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2018, 49(13): 3095-3101 |
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| Authors: | NIE Jia-hui ZHANG Fu-sheng TIAN Dong GUO Dong LEI Zhen-hong QIN Xue-mei LI Zhen-yu |
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| Affiliation: | Modern Research Center for Traditional Chinese Medicine, Shanxi University, Taiyuan 030006, China;College of Chemistry and Chemical Engineering, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,Modern Research Center for Traditional Chinese Medicine, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,Modern Research Center for Traditional Chinese Medicine, Shanxi University, Taiyuan 030006, China;College of Chemistry and Chemical Engineering, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,ZhenDong Group, Changzhi 047100, China,ZhenDong Group, Changzhi 047100, China,Modern Research Center for Traditional Chinese Medicine, Shanxi University, Taiyuan 030006, China and Modern Research Center for Traditional Chinese Medicine, Shanxi University, Taiyuan 030006, China |
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