| 滇龙胆环烯醚萜氧化酶基因及启动子的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张晓东,李彩霞,赵青蓉,王元忠.滇龙胆环烯醚萜氧化酶基因及启动子的克隆与生物信息学分析[J].中草药,2018,49(18):4386-4392. |
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| 作者姓名： | 张晓东 李彩霞 赵青蓉 王元忠 |
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| 作者单位： | 玉溪师范学院化学生物与环境学院;云南省农业科学院药用植物研究所 |
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| 基金项目： | 云南省教育厅重点项目（2015Z171）；云南省大学生创新项目（201511390006）；云南省自然科学基金重点项目（2017FA049） |
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| 摘 要： | 目的从滇龙胆叶片中克隆单萜合成关键酶环烯醚萜氧化酶(GrIDO)基因及其启动子序列,并进行序列分析。方法根据滇龙胆转录组GrIDO基因序列设计基因特异性引物,使用RT-PCR方法克隆GrIDO基因的开放阅读框(open reading frame,ORF)序列,基于在线软件对GrIDO基因序列进行生物信息学分析。同时,根据GrIDO基因ORF序列,设计特异性引物,采用PCR法对该基因启动子序列进行扩增,并进行序列分析。结果 GrIDO基因(GenBank登录号KP722034)ORF全长1 557 bp,编码518个氨基酸;GrIDO蛋白相对分子质量58 920,理论等电点8.40,属于细胞色素P450超家族成员,可能定位于叶绿体;无信号肽,为亲水不稳定蛋白,主要由α-螺旋(51.07%)和环(42.69%)构成;GrIDO蛋白与长春花CrIDO蛋白具有较高的相似性(85.83%),且亲缘关系较近。GrIDO基因启动子(GenBank登录号KT428570)长720 bp,具有TATA-box和CAAT-box,还具有参与脱落酸和茉莉酸甲酯应答的顺式作用元件、光应答元件和MYB结合位点。结论GrIDO基因表达受多种因素调控。克隆了GrIDO基因ORF及其启动子,为GrIDO基因的功能验证奠定基础。
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| 关 键 词： | 滇龙胆 环烯醚萜氧化酶 基因和启动子克隆 生物信息学分析 开放阅读框 |
| 收稿时间： | 2018/1/17 0:00:00 |
Cloning and bioinformatics analysis of iridoid oxidase gene in Gentiana rigescens |
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| ZHANG Xiao-dong,LI Cai-xi,ZHAO Qing-rong and WANG Yuan-zhong.Cloning and bioinformatics analysis of iridoid oxidase gene in Gentiana rigescens[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2018,49(18):4386-4392. |
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| Authors: | ZHANG Xiao-dong LI Cai-xi ZHAO Qing-rong and WANG Yuan-zhong |
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| Institution: | College of Chemistry Biology and Environment, Yuxi Normal University, Yuxi 653100, China,College of Chemistry Biology and Environment, Yuxi Normal University, Yuxi 653100, China,College of Chemistry Biology and Environment, Yuxi Normal University, Yuxi 653100, China and Institute of Medicinal Plants, Yunnan Academy of Agricultural Sciences, Kunming 650223, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Gentiana rigescens Franch iridoid oxidase gene and promoter cloning bioinformatics analysis open reading frame |
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