基于生物信息学方法分析脑胶质瘤组织中糖蛋白M6A的表达

目的 探讨糖蛋白M6A(glycoprotein M6A,GPM6A)在脑胶质瘤标本中的表达及其临床意义。方法 运用生物信息学方法分析中国脑胶质瘤基因组图谱(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)数据库325例患者GPM6A表达情况及其与临床病理参数关系。运用STRING在线数据库筛选分析GO功能注释以及与GPM6A相互作用的可能蛋白-蛋白作用功能网络。利用TIMER2.0数据库评估GPM6A与胶质瘤细胞纯度及浸润性CD8⁺T细胞水平之间的关系。结果 CGGA数据库在线分析显示,在各病理组织学分级(WHO:G₂、G₃、G₄级)与各组织学病理分型中均有GPM6A表达,各分级或各分型脑胶质瘤的GPM6A表达水平比较,差异均有统计学意义(分级:F=50.25,P＜0.001；分型:F=14.26,P＜0.001)；GPM6A表达水平与分子IDH突变状态、1p19q联合缺失以及患者年龄密切相关,差异有统计学意义(P均＜0.01),但与患者性别无关(t=1.45,P>0.05)。GPM6A表达水平在原发性胶质瘤中稍高于继发性胶质瘤,差异无统计学意义(t=1.82,P＞0.05)。患者生存期数据分析显示,在低级别胶质瘤中GPM6A低表达的患者生存期较GPM6A高表达患者明显缩短(χ²=69.79,P＜0.001),但GBM患者中,无论GPM6A表达水平高低,生存期差异无统计学意义(χ²=0.63,P＞0.05)。GO功能分析显示,GPM6A与神经系统中跨膜蛋白运输、突触形成与发育、细胞之间信息交流等功能密切相关。TIMER2.0数据库分析显示GPM6A与胶质瘤肿瘤细胞纯度和浸润的CD8⁺T细胞水平正相关。结论 GPM6A低表达胶质瘤患者预后显著差于高表达患者,其表达水平可作为评估胶质瘤预后的预测因素。