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痰中结核分枝杆菌DNA提取方法的比较及在LAMP检测中的应用
作者姓名:文岚  王孝君  郭彦昌  欧新华  张兵  田斌
作者单位:长沙市疾病预防控制中心
基金项目:长沙市科技计划项目(NO.K1104052-21)
摘    要:目的:对5种DNA提取方法进行比对,为选择适用于痰中结核分枝杆菌DNA的提取方法提供依据。方法:采用PureLink genomic DNA kits(PLKm)、苯酚与氯仿法(PCm)、Chelex-100法(Cm)、磷酸盐缓冲液法(PBm)及硅珠法(SBm)5种方法提取痰标本中的DNA,对提取产物的浓度、纯度等技术指标进行分析,并对核酸扩增结果进行统计。结果:DNA浓度均值由高到低依次是PBm、Cm、PCm、SBm、PLKm,组间比较差异有统计学意义,两两比较发现PLKm与PCm、Cm、PBm之间差异有统计学意义,但Cm与SBm间的比较有统计学意义;5种提取方法的OD260:OD280比值均值与1.8的接近程度依次是PLKm、PCm、Cm、PBm、SBm,组间比较差异有统计学意义,两两比较发现除SBm与另外4种方法间存的差异具有统计学意义外,其余各组间的比较均无统计学意义;采用PLKm、PCm及Cm提取的产物均扩增出阳性结果,而PBm、SBm提取产物分别有18例和11例未获得阳性结果,经Mc-Nemar x2检验方法间的差异有统计学意义。结论:Chelex-100提取痰标本中结核分枝杆菌DNA是一种简便、省时、廉价适用于基层结核病实验室进行核酸检测的方法。

关 键 词:结核分支杆菌  DNA提取  
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