| 老年原发性直肠癌组织中miRNA-143和miRNA-221的靶基因预测及相关生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李志祥,钱军,贾建光. 老年原发性直肠癌组织中miRNA-143和miRNA-221的靶基因预测及相关生物信息学分析[J]. 中华全科医学, 2018, 16(8): 1257. DOI: 10.16766/j.cnki.issn.1674-4152.000345 |
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| 作者姓名： | 李志祥 钱军 贾建光 |
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| 作者单位： | 蚌埠医学院第一附属医院肿瘤外科, 安徽 蚌埠 233004 |
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| 基金项目： | 安徽高校自然科学研究项目(KJ2017A240) |
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| 摘 要： | 目的 探讨miRNA-143和miRNA-221在老年直肠癌中的诊断价值及临床意义。 方法 收集2015年9月-2016年12月蚌埠医学院第一附属医院老年直肠癌患者标本50例和健康人群标本30例,使用高通量测序技术、荧光定量PCR检测验证直肠癌及正常组织中miRNA差异表达;Pearson检验对miRNA-143和miRNA-221进行相关性分析;miRBase数据库预测两者miRNA的靶基因;R 3.4.0软件绘制差异miRNA热图聚类图,miRNet数据库和cytoscape 3.5.1绘制miRNA与mRNA表达调控网络。 结果 对比正常组织,miRNA-143和miRNA-221在老年原发性直肠癌组织中均下调(P<0.001,P=0.009),两者表达水平呈正相关(r=0.517,P=0.003)。GO功能注释主要富集于MAPKK活性、干细胞发育、STAT蛋白酪氨酸磷酸化调控、蛋白质磷酸化氨基酸结合、酪氨酸磷酸化肽、调节脂质激酶活性、磷蛋白聚合、核转录mRNA聚A尾缩短等生物学过程和分子功能(P<0.01);KEGG信号通路富集主要涉及TP53基因调节细胞死亡基因转录、VEGF信号通路、IL-4信号通路、抑瘤素M信号通路(P<0.01)。调控网络表明miRNA-143和miRNA-221之间有少许靶基因重合,两者之间具有协同作用。 结论 miRNA-143和miRNA-221作为直肠癌抑癌因子,为临床老年直肠癌的诊断提供一定的临床意义。
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| 关 键 词： | 直肠癌 二代测序 GO注释 KEGG信号通路 调控网络 |
| 收稿时间： | 2018-03-25 |
Bioinformatics analysis of predicted target genes of miRNA-143 and miRNA-221 in elderly primary rectal carcinoma |
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| Affiliation: | Department of Surgical Oncology, the First Affiliated Hospital of Bengbu Medical College, Bengbu, Anhui 233004, China |
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