| 2015年昆明市柯萨奇病毒A16型VP1区基因特征分析 |
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| 引用本文： | 文婕, 王鹏飞, 李秀芳, 曹霞. 2015年昆明市柯萨奇病毒A16型VP1区基因特征分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2018, 22(6): 607-612. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2018.06.016 |
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| 作者姓名： | 文婕 王鹏飞 李秀芳 曹霞 |
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| 作者单位： | 1. 昆明医科大学第二附属医院中心实验室, 云南 昆明 650101;;;2. 昆明市妇幼保健院急诊科, 云南 昆明 650031 |
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| 基金项目： | 云南省教育厅科学研究基金项目（2015C024Y） |
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| 摘 要： | 目的 研究昆明市2015-2016年手足口病患儿肠道病毒分子流行病学及探讨柯萨奇病毒A组16型（coxsackievirus A16，CVA16）VP1基因遗传变异与其时间和空间分布模式的相关性。方法 采集患儿的咽拭子和肛拭子样本，采用逆转录聚合酶链式反应分子鉴定法分别扩增肠道病毒71型和CVA16的VP1基因全长，随机选取2015年9份CVA16阳性样本进行测序并与数据库参考株构建系统进化树。对不同年份来源的CVA16病毒株间遗传距离与分离年份时间进行相关性和回归分析，并分析不同地理群体间的遗传距离与地理距离的相关性（Mantel检测）。结果 采样年度中大多数患儿为CVA16感染（咽拭子和肛拭子检出率分别为29.41%和15.69%），其与肠道病毒71型感染的比率分别为2.5 ∶1和2.0 ∶1。VP1基因系统进化分析显示9株CVA16昆明分离株均属于B基因型B1b亚型，且进一步划分成两个亚簇；种系进化及统计学分析显示VP1基因变异与时间推移和地理距离均具有正相关关系（均有P<0.05）。结论 2015年昆明市9株CVA16分离株为新生成的变异毒株，提示CVA16在昆明存在一定的地域流行特点。
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| 关 键 词： | 手足口病 柯萨奇病毒A16型 VP1区 基因特征 系统进化分析 |
| 收稿时间： | 2017-11-15 |
| 修稿时间： | 2018-02-28 |
Genetic characteristics analyses of the VP1 gene in coxsackievirus A16 isolates from Kunming in 2015 |
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| WEN Jie, WANG Peng-fei, LI Xiu-fang, CAO Xia. Genetic characteristics analyses of the VP1 gene in coxsackievirus A16 isolates from Kunming in 2015[J]. CHINESE JOURNAL OF DISEASE CONTROL & PREVENTION, 2018, 22(6): 607-612. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2018.06.016 |
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| Authors: | WEN Jie WANG Peng-fei LI Xiu-fang CAO Xia |
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| Affiliation: | 1. Central Laboratory, the Second Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming 650101, China;;;2. Emergency Department, Kunming Maternal and Child Health Care Hospital, Kunming 650031, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hand-foot-mouth disease Coxsackievirus A16 VP1 region Genetic characteristics Phylogenetic analysis |
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