神经母细胞瘤SK—N—SH细胞在氯化钴模拟缺氧后侧群细胞基因表达谱的变化北大核心CSCD

目的探讨SK—N—SH神经母细胞瘤株在氯化钴模拟缺氧条件下侧群（sidepopulation，SP）细胞比例的变化及SP细胞基因表达谱的改变。方法采用二氯化钴模拟缺氧条件，然后利用Hoechst33342染料法，通过流式细胞仪紫外激光检测分选功能分选出缺氧及常氧SK—N—SH细胞中的SP细胞，利用Agilent8×60K人（Human）G3表达谱芯片进行检测，并对基因芯片结果进行分析，以荧光定量PCR验证芯片结果。结果SK—N—SH细胞株的SP细胞比例约为8．65％，缺氧后降至约2．08％；缺氧SP细胞和常氧SP细胞mRNA及lincRNA的表达谱存在明显差异。差异〉2倍的基因有5077mRNA、1383lincRNA、其中上调的有2550mRNA、572lincRNA，下调的有2527mRNA、811lincRNA。差异表达的基因主要涉及细胞周期、DNA复制、p53及MAPK信号通路等生物学过程。荧光定量PCR基因结果与芯片差异基因结果表达趋势一致。结论缺氧使SP细胞比例下降，并使SP细胞mRNA和lincRNA的表达谱均发生显著改变，提示mRNA和lincRNA共同参与调节神经母细胞瘤SP细胞在缺氧环境中的生物学行为。