| 基于STAT3-CASP4/5通路诱导银屑病细胞焦亡基因调控网络的构建及潜在药物预测 |
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| 引用本文： | 王家悦,陈朝霞,王燕,赵京霞,底婷婷,胡雪晴,曲保全,李萍. 基于STAT3-CASP4/5通路诱导银屑病细胞焦亡基因调控网络的构建及潜在药物预测[J]. 中草药, 2023, 54(24): 8142-8152 |
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| 作者姓名： | 王家悦 陈朝霞 王燕 赵京霞 底婷婷 胡雪晴 曲保全 李萍 |
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| 作者单位： | 首都医科大学附属北京中医医院, 银屑病中医临床基础研究北京市重点实验室, 北京市中医药研究所, 北京 100010 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（82074435）;2022年青年岐黄学者培养项目 |
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| 摘 要： | 目的 基于基因调控网络分析银屑病中细胞焦亡相关基因的表达模式,并探讨其在银屑病的发生和发展中的作用,以寻找可能的治疗方案。方法 使用NCBI基因表达Omnibus数据库获取银屑病患者皮损区和非皮损区样本的基因表达数据集。利用limma算法筛选出差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）,并运用WebGestalt对DEGs进行富集分析。收集与细胞焦亡和银屑病相关的共有基因,并利用GENIE3构建共有基因的上游转录调节网络。使用HERB和COREMINE数据库预测可能干预细胞焦亡和银屑病互作机制的中药和化学药。结果 在银屑病的发病过程中,包括半胱氨酸蛋白酶4/5/8(cysteinasparate protease 4/5/8,CASP4/5/8)在内的13个细胞焦亡基因参与了程序性细胞死亡的调节、蛋白酶活性的调控、内肽酶活性的调节以及白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)的产生等过程。通过识别共享基因,发现这些基因的转录过程受到包括信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator ...
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| 关 键 词： | 细胞焦亡 STAT3-CASP4/5通路 银屑病 中医药 生物信息学 中药新药开发 |
| 收稿时间： | 2023-08-10 |
Construction of regulatory network of psoriasis cell pyroptosis gene induced by STAT3-CASP4/5 pathway and prediction of potential drugs |
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| WANG Jia-yue,CHEN Zhao-xi,WANG Yan,ZHAO Jing-xi,DI Ting-ting,HU Xue-qing,QU Bao-quan,LI Ping. Construction of regulatory network of psoriasis cell pyroptosis gene induced by STAT3-CASP4/5 pathway and prediction of potential drugs[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2023, 54(24): 8142-8152 |
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| Authors: | WANG Jia-yue CHEN Zhao-xi WANG Yan ZHAO Jing-xi DI Ting-ting HU Xue-qing QU Bao-quan LI Ping |
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| Affiliation: | Beijing Institute of Traditional Chinese Medicine, Beijing Key Laboratory of TCM Clinical Basic Research on Psoriasis, Beijing Hospital of Traditional Chinese Medicine Affiliated to Capital Medical University, Beijing 100010, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | pyroptosis STAT3-CASP4/5 pathway psoriasis traditional Chinese medicine bioinformatics development of new Chinese materia medica |
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