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USP39在肝细胞癌中的表达及其与预后、免疫浸润的相关性分析
引用本文:李浩令,包智航,仰高伟,倪宇轩,王文锐. USP39在肝细胞癌中的表达及其与预后、免疫浸润的相关性分析[J]. 牡丹江医学院学报, 2022, 43(1): 16-22
作者姓名:李浩令  包智航  仰高伟  倪宇轩  王文锐
作者单位:蚌埠医学院 癌症转化医学安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 233030;蚌埠医学院 癌症转化医学安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 233030;蚌埠医学院 生命科学学院,安徽 蚌埠 233030
基金项目:国家级大学生创新创业训练计划项目(202110367011);
摘    要:目的探究去泛素化酶USP39在肝细胞癌(Liver hepatocellular carcinoma, LIHC)中的表达及其与预后、免疫浸润的关系,并预测其生物学功能。方法从癌症基因组图谱(The cancer Genome Atlas, TCGA)数据库和国际癌症基因组协会(The International Cancer Genome Consortium, ICGC)数据库获取原始数据,采用表达差异分析、临床相关性分析、Kaplan-Meier分析、单因素和多因素Cox分析USP39在评估肝细胞癌患者预后中的作用。采用ICGC对USP39在TCGA-LIHC中的表达及生存分析进行验证。应用基因集富集分析(gene-set enrichment analysis, GSEA)软件预测USP39可能参与的分子通路,并分析USP39与潜在靶基因的相关性。通过肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource, TIMER)数据库分析USP39与肝细胞癌免疫浸润的关系。结果 USP39在肝细胞癌组织中显著高表达(均FDR<0.05),USP39表达...

关 键 词:肝细胞癌  USP39  预后  免疫细胞浸润  生物信息学分析

Analysis of the correlation between the expression of USP39 in hepatocellular carcinoma and immune infil-tration and prognosis
LI Hao-ling. Analysis of the correlation between the expression of USP39 in hepatocellular carcinoma and immune infil-tration and prognosis[J]. Journal of Mudanjiang Medical College, 2022, 43(1): 16-22
Authors:LI Hao-ling
Abstract:
Keywords:
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