小麦过敏原Tri a Bd 27k蛋白抗原表位预测及三维结构模拟 |
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引用本文: | 翟锦明,何颖,陈惠芳,刘雪婷,邹泽红,夏宏林. 小麦过敏原Tri a Bd 27k蛋白抗原表位预测及三维结构模拟[J]. 现代预防医学, 2013, 40(15): 2867-2871 |
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作者姓名: | 翟锦明 何颖 陈惠芳 刘雪婷 邹泽红 夏宏林 |
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作者单位: | 1. 广州医学院第二附属医院,广东广州,510260 2. 广州医学院第二附属医院,广东广州510260;广州市过敏反应与临床免疫重点实验室/呼吸疾病国家重点实验室变态反应研究室 |
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基金项目: | 广东省医学科研基金课题,国家自然科学基金项目,国家科技重大专项 |
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摘 要: | 目的 通过生物信息学方法了解小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构特征,为小麦变态反应性疾病的诊断和预防提供依据.方法 在Uniprot数据库中获得Tri a Bd 27k蛋白序列,通过DNAStar预测B细胞抗原表位,NetMHCⅡ和Syfpeithi预测T细胞抗原表位;使用Swiss-Model软件预测其三维结构并用Ramachandran进行稳定性评估.在Uniport 数据库搜索Tria Bd 27k的同源蛋白,应用Clustalx 1.83及Mega 3.1构建同源进化树.结果 小麦过敏原Tri a Bd 27k的B/T细胞共同抗原表位优势区域为34-42、102-117,Ramachandran软件预测结果显示小麦Tri a Bd 27k蛋白的空间构象稳定.结论 通过对小麦过敏原Tria Bd 27k进行生物信息学分析获得了该过敏原优势区域及三维结构模型,为进一步了解和掌握小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构功能打下理论基础.
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关 键 词: | 小麦过敏原 Tri a Bd 27k 抗原表位 三维结构 |
Prediction of epitopes and three-dimensional structure modeling from triticum aestivum allergen Tri a Bd 27k |
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Abstract: | |
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Keywords: | Triticum aestivum allergen Tri a Bd 27k Epitope Three-dimensional structure |
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