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中国乙型肝炎病毒基因组序列突变及进化分析
引用本文:郭永豪,豆巧华,刘倩,杨建辉,吕宛玉,丰达星,僧明华,张延炀,赵东阳. 中国乙型肝炎病毒基因组序列突变及进化分析[J]. 中华流行病学杂志, 2022, 43(8): 1309-1314
作者姓名:郭永豪  豆巧华  刘倩  杨建辉  吕宛玉  丰达星  僧明华  张延炀  赵东阳
作者单位:河南省疾病预防控制中心免疫预防医学重点实验室, 郑州 450016
基金项目:河南省自然科学基金(222300420466);河南省医学科技攻关项目(2018010028)
摘    要:目的 了解中国乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)基因组序列的免疫逃逸突变、耐药突变和基因组进化信息。方法 选取1998-2021年在GenBank中的中国HBV全基因组序列信息作为分析对象,采用MAFFT软件进行聚类分析,使用在线工具Gen2pheno进行免疫逃逸突变和耐药突变分析,使用BEAST 1.10.4做序列的时间进化分析。结果 5 426条序列纳入分析集,分布于我国19个省份,C型占比最高(59.1%,3 211/5 426)。其次为B型(33.7%,1 833/5 426)。有764条(14.1%,764/5 426)序列发生了免疫逃逸突变,98.1%的序列至少发生了1处反转录酶编码区域突变。中国大部分系列的进化根在公元1801年左右。结论 中国HBV耐药突变率较高,HBV基因组进化缓慢。

关 键 词:乙型肝炎  基因组耐药和免疫逃逸突变  基因组进化
收稿时间:2022-04-11

Analysis on the sequence mutation and evolution of HBV genome in China
Guo Yonghao,Dou Qiaohu,Liu Qian,Yang Jianhui,Lyu Wanyu,Feng Daxing,Seng Minghu,Zhang Yanyang,Zhao Dongyang. Analysis on the sequence mutation and evolution of HBV genome in China[J]. Chinese Journal of Epidemiology, 2022, 43(8): 1309-1314
Authors:Guo Yonghao  Dou Qiaohu  Liu Qian  Yang Jianhui  Lyu Wanyu  Feng Daxing  Seng Minghu  Zhang Yanyang  Zhao Dongyang
Affiliation:Medicine Key Laboratory of Immunoprophylaxis, Henan Center for Disease Control and Prevention, Zhengzhou 450016, China
Abstract:
Keywords:Hepatitis B  Genomic drug resistance and immune escape mutations  Genomic evolution
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