| 心肌层表达tRNA源性小片段RNA |
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| 引用本文： | 许甘霖,齐绪峰,蔡冬青.心肌层表达tRNA源性小片段RNA[J].基础医学与临床,2016(7):907-911. |
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| 作者姓名： | 许甘霖 齐绪峰 蔡冬青 |
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| 作者单位： | 暨南大学 再生医学教育部重点实验室 科技部及广东省国际科技合作基地 发育与再生生物学系,广东 广州,510632 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(30973158;81470433)，863计划(2007AA02Z105)，科技部港澳台合作专项(2012DFH30060)，广东省教育厅国际合作平台项目(2012gjhz0003)，广东省自然科学基金重点项目(04105826;S2012020010895)，广东省科技厅国际合作平台项目(2009B050900007;2013B051000062)，广东省科技计划项目(2015B020211010) |
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| 摘 要： | 目的研究大鼠左心室前壁(相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区)是否存在转移核糖核酸来源的小片段RNA(tRFs)的表达。方法分离出大鼠左心室前壁(相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区)的心肌组织并提取总RNA。使用Illumina技术对小片段RNA进行测序,以获的该两个区域的50 nt以下小片段RNA的序列及表达量信息。利用Fstax和Bowtie软件,及Perl语言编程对长度为30~36 nt部分的小片段RNA进行注释,并比较两个区域tRF表达量差异。结果大鼠心脏左心室前壁(相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区)的心肌组织存在tRF表达,而来源于tRNA的tRFs分别占总小片段RNA的9.15%和7.30%。且两个区域的经鉴别的28中tRFs种类及表达量十分接近。无论是相当于梗死区还是相当于边缘区的心肌组织,Gly GCC和Val CAC两个tRNA来源的tRFs占了所有tRFs的84.73%和84.66%。每一种tRNA来源的tRFs在两个区域间的表达差异小于4%。结论生理状态下心肌组织存在tRF表达,相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区的心肌tRFs表达谱是十分接近的。
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| 关 键 词： | tRFs 小片段RNA 左心室前壁 心肌梗死 |
Expression of tRNA-derived fragments in myocardium |
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| Keywords: | tRFs small RNAs left ventricular free wall myocardial infarction |
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