nPTB基因座上T-uc.33在小鼠神经系统发育中的功能 |
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引用本文: | 朱丽媛,赵阿妮,张靖,侯琳,阴彬,彭小忠. nPTB基因座上T-uc.33在小鼠神经系统发育中的功能[J]. 基础医学与临床, 2016, 0(7): 962-968 |
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作者姓名: | 朱丽媛 赵阿妮 张靖 侯琳 阴彬 彭小忠 |
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作者单位: | 中国医学科学院基础医学研究所 北京协和医学院基础学院 生物化学与分子生物学系 医学分子生物学国家重点实验室,北京,100005 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31301151) |
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摘 要: | 目的 n PTB基因座上T-uc.33这一超保守长非编码RNA的鉴定及其在小鼠神经系统发育过程中的功能。方法利用生物信息学方法和实验对现存的481个超保守区域(UCRs)进行数据挖掘和检测,筛选到n PTB基因座上存在的UCR,即T-uc.33,并用RACE扩增T-uc.33的RNA转录本全长;用实时荧光定量PCR检测T-uc.33和n PTB在小鼠脑组织发育及神经干细胞分化不同时间点的表达谱;用siRNAs转染细胞法检测T-uc.33对n PTB所起的调控作用。结果筛选并鉴定了n PTB基因座上的T-uc.33为真实转录的超保守长非编码RNA,全长为807 nt;T-uc.33和n PTB在小鼠脑组织中的表达呈显著正相关(P0.01),并随着脑组织发育从胚胎到成年期呈现先升高后降低的趋势,在体外神经干细胞分化过程也存在差异表达;敲低T-uc.33可显著降低n PTB的表达(P0.01)。结论 T-uc.33为n PTB基因座上的超保守长非编码RNA,对n PTB起到正向调控作用,潜在地影响小鼠脑组织发育和神经干细胞的分化过程。
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关 键 词: | 超保守区域(UCR) nPTB 神经发育 长非编码RNA(lncRNA) |
T-uc.33 located in the genomic loci of nPTB may function in the neural development |
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Abstract: | |
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Keywords: | ultra-conserved regions (UCRs) nPTB neural development long non-coding RNAs (lncRNAs) |
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