基于生物信息学方法探讨Her-2基因表达对胃癌免疫细胞浸润的影响

目的 探讨人类表皮生长因子受体2（human epidermal growth factor receptor-2，Her-2）对胃癌组织中免疫细胞浸润的影响及可能的机制。方法 从癌症基因组图谱（the Cancer Genome Atlas，TCGA）数据库下载胃癌转录测序数据及临床资料。采用CIBERSORT反卷积算法获得胃癌微环境中浸润的免疫细胞占比，分析其与Her-2表达的关系，筛选Her-2基因潜在的调控浸润免疫细胞的类型。采用基因集变异分析（gene set variation analysis，GSVA）评估与胃癌组织Her-2表达相关的信号通路集合，利用GEO（gene expression omnibus）收录的胃癌转录组数据验证Her-2基因表达与胃癌免疫细胞浸润程度的关系。结果 CIBERSORT分析TCGA数据库胃癌样本发现CD8⁺T细胞、静息状态记忆性CD4⁺T细胞、M0型巨噬细胞及肥大细胞在Her-2高表达及低表达组中的浸润程度差异有统计学意义（P=0.029，0.049，0.027，0.008）。GEO数据库与TCGA数据库分析结果均显示，Her-2基因高表达与CD8⁺ T细胞、静息状态记忆性CD4⁺T细胞、M0型巨噬细胞及肥大细胞的发育、诱导分化、迁移调控有关（P<0.05），并影响胃癌组织中部分免疫细胞的浸润能力和程度。结论 在胃癌中Her-2基因高表达可能对部分免疫细胞形成和功能发挥具有抑制作用。

Exploring the effect of Her-2 gene expression on immune cell infiltration in gastric cancer based on bioinformatics method