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基于COI条形码序列的《中国药典》动物药材鉴定研究
引用本文:张辉,姚辉,崔丽娜,杜鹤,林喆,高晓晨,郎雪,宋经元,罗焜,石林春,陈士林.基于COI条形码序列的《中国药典》动物药材鉴定研究[J].世界科学技术-中医药现代化,2013,15(3):371-380.
作者姓名:张辉  姚辉  崔丽娜  杜鹤  林喆  高晓晨  郎雪  宋经元  罗焜  石林春  陈士林
作者单位:长春中医药大学中医药与生物工程研发中心 长春 130117;中国医学科学院/北京协和医学院/药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室 北京 100193;长春中医药大学中医药与生物工程研发中心 长春 130117;长春中医药大学中医药与生物工程研发中心 长春 130118;长春中医药大学中医药与生物工程研发中心 长春 130119;长春中医药大学中医药与生物工程研发中心 长春 130120;长春中医药大学中医药与生物工程研发中心 长春 130121;中国医学科学院/北京协和医学院/药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室 北京 100193;中国医学科学院/北京协和医学院/药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室 北京 100194;中国医学科学院/北京协和医学院/药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室 北京 100195;中国医学科学院/北京协和医学院/药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室 北京 100196
基金项目:吉林省财政厅高等教育专项(2050205):药用动物DNA 条形码鉴定技术,负责人:张辉;国家中医药管理局中医药科学技术研究重大专项(国中医药科2004ZX04):《中国药典》名贵珍稀动物药及混伪品DNA 条形码发展鉴定技术体系规范应用研究,负责人:张辉。
摘    要:药用动物是我国中药资源的重要组成部分,线粒体COI 基因被公认为动物界中标准的DNA 条形码基因,但利用此技术系统研究药用动物或动物药材鉴定的报道不多。本研究选取药典中45 个动物药材,涉及基原物种51 种,分析样品COI 序列的种内种间变异情况,barcoding gap,鉴定效率等,考察COI 序列鉴定动物药材的有效性和准确性。结果表明,种间变异最小值远大于种内变异最大值,barcoding gap 图显示种间变异和种内变异重合较少,鉴定效率较高,除节肢动物门外,在物种水平和属水平上,鉴定效率均为100%,所构建的动物药材及其混伪品的NJ 树能很好地区分正品来源与其混伪品。因此COI 序列作为DNA 条形码适用于药典中动物药材的鉴定。本研究为COI 条形码准确鉴定药典中动物药材提供了分子依据,扩充了DNA 条形码数据库中药用动物序列,并建立了利用此技术鉴定动物药材的具体技术流程。

关 键 词:动物药材  药典  COI序列  DNA条形码  鉴定
收稿时间:2013/5/24 0:00:00
修稿时间:6/4/2013 12:00:00 AM

Application of COI-based DNA Barcoding for Identifying Animal Medical Materials in the Chinese Pharmacopoeia
Zhang Hui,Yao Hui,Cui Lin,Du He,Lin Zhe,Gao Xiaochen,Lang Xue,Song Jingyuan,Luo Kun,Shi Linchun and Chen Shilin.Application of COI-based DNA Barcoding for Identifying Animal Medical Materials in the Chinese Pharmacopoeia[J].World Science and Technology-Modernization of Traditional Chinese Medicine,2013,15(3):371-380.
Authors:Zhang Hui  Yao Hui  Cui Lin  Du He  Lin Zhe  Gao Xiaochen  Lang Xue  Song Jingyuan  Luo Kun  Shi Linchun and Chen Shilin
Institution:Development Center of Traditional Chinese Medicine and Bioengineering, Changchun University of Chinese Medicine, Changchun 130117, China;National Engineering Laboratory for Breeding of Endangered Medicinal Materials, Ministry of Education, Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China;Development Center of Traditional Chinese Medicine and Bioengineering, Changchun University of Chinese Medicine, Changchun 130117, China;National Engineering Laboratory for Breeding of Endangered Medicinal Materials, Ministry of Education, Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China
Abstract:Medicinal animals are important part of Traditional Chinese medicine resources in China. Cytochrome coxidase subunit I (COI) was selected as the standard DNA barcoding sequence for animal medical materials. In this study, the 51 animal species from 45 animal medical materials in the Chinese Pharmacopoeia were selected and the intra-specific variation and the inter-specific divergence, the barcoding gap, the identification efficiency of their COI sequences were analyzed. The results showed that the inter-specific divergence is higher than intraspecific distance. The barcoding gap existed between inter-specific sequence divergence and intra-specific distance. The identification efficiencies were 100% both at the genus and species level except the Arthropoda. The cluster dendrogram exhibited that different species distinguished from others. Therefore, COI sequence as a barcode is suitable to identify the species of animal medical materials in Chinese Pharmacopoeia.
Keywords:Animal medical material  Chinese Pharmacopoeia  COI sequences  DNA barcoding  identification
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