蛇毒Ⅰ型和Ⅱ型磷脂酶A2基因密码使用的比较和分析

目的：通过比较和分析蛇毒中Ⅰ型和Ⅱ型磷脂酶Az（phospholipaseAz，PLAz）基因编码的特点，了解蛇毒中两类PLA2分子，圭物学的信息。方法：从国际基因库中搜寻所有蛇毒PLA：基因信息（mRNA），对于符合研究条件的基因，利用CodonW分析软件和计算机进行分析，计算出两类PLA2的同义密码相对运用值（RelativeSynonymousCodonUsage，RSCU），编码区鸟嘌呤／胞嘧啶（GC）含量和GC在三联体密码子中第3位置上所占的百分比（GC3S）含量，以及4种类型的碱基的含量。结果：眼镜蛇科Ⅰ型PLA2和蝰蛇科Ⅱ型PLA2基因编码区GC含量明显不同，蝰蛇科Ⅱ型PLAz的GC含量和GC3S含量分别为53．05％和65．53％，明显高于眼镜蛇科的Ⅰ型PLA。的49．48％和49．68％；RSCU值显示眼镜蛇科Ⅰ型PLA2对29个密码子具有偏好性，蝰蛇科Ⅱ型的有27个密码子，两类PLA2偏好使用的密码有明显不同；蝰蛇科Ⅱ型PLAz的RSCU相对较高；在可以选择密码子的19个氨基酸中，两类PLA。在12个氨基酸有着不同的偏好性；终止密码子具有特殊的偏好性，RSCU值均很高。结论：眼镜蛇科和蝰蛇科的两类PLA2基因在密码子使用上有明显不同的偏好性，蝰蛇科的PLAz偏好程度更强些，这可能与蝰蛇科的PLAz基因位于Gc丰富的区域有关。