生物信息学分析心脏发育时期腔室基因的表达

目的心房和心室的分化是心脏发育研究领域的一个重要问题。我们希望利用公共数据库的数据寻找和整弹心房和心室特异表达的基因，为回答腔室分化这个基础研究问题提供新的线索。方法在本文中，我们采用生物信息学的方法归纳了心房和心室特异基因，然后，利用DAVID软件对这些腔室特异基因进行了功能分析。结果实验结果证实了公共数据库的芯片数据与已有的文献报道一致。分析结果找到162个心房基因，80个心室基因。据此，我们定义了新的谱系特异的房室基因。此外，DAVID软件分析结果发现心房基因更多地包含分泌蛋白，而心室基因更多地参与心肌病的信号通路。结论心房和心室特异基因是我们解决心脏发育过程中分化问题的第一步，这些基因仅仅占整个转录组的很少一部分，为我们今后发育和疾病领域的研究提供了方向。