| 摘 要： | 目的 应用生物信息学方法筛选肝细胞癌中差异表达的环状RNA (circRNA)，构建肝癌预后相关circRNA-微RNA (miRNA)-mRNA调控网络。方法 从基因表达综合（GEO）数据库中下载肝癌相关circRNA数据集，应用GEO2R工具筛选差异表达circRNA，在Circular RNA Interactome及circBank数据库中预测与circRNA相结合的miRNA，在miRDB、RNAInter及TargetScan数据中预测miRNA的靶基因，构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。应用DAVID软件、STRING数据库、Cytoscape软件及GEPIA数据库对靶基因进行功能注释、通路分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络（PPI）构建及预后分析，最后确定肝癌预后相关circRNA-miRNA-核心靶基因调控网络。结果 筛选出1个circRNA，为hsa＿circRNA＿0000301，与之结合的miRNA有4个，分别为hsamiR-377-3p、hsa-miR-767-3p、hsa-miR-1178-3p及hsa-miR-1228-3p。功能注释和通路富...
|
