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| 河南和新疆地区HIV-1毒株gp120和gag基因的变异分析 | |
| 引用本文： | 宋艳辉,邢辉,王哲,张远志,孙峰,何翔,陈建平,邵一鸣. 河南和新疆地区HIV-1毒株gp120和gag基因的变异分析[J]. 中国艾滋病性病, 2007, 13(5): 405-408 |
| 作者姓名： | 宋艳辉 邢辉 王哲 张远志 孙峰 何翔 陈建平 邵一鸣 |
| 作者单位： | 1. 中国科学院武汉病毒研究所,湖北,武汉,430071;中国科学院研究生院,北京,100039;中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心,传染性疾病预防与控制国家重点实验室,北京,100050 2. 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心,传染性疾病预防与控制国家重点实验室,北京,100050 3. 河南省疾病预防控制中心,郑州,450003 4. 新疆维吾尔族自治区疾病预防控制中心,乌鲁木齐,830001 5. 中国科学院武汉病毒研究所,湖北,武汉,430071;中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心,传染性疾病预防与控制国家重点实验室,北京,100050 |
| 摘 要： | 目的分析中国河南和新疆地区艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)毒株gp120和gag基因全长序列的变异特征。方法PCR扩增河南和新疆HIV-1确认阳性样本前病毒DNA gp120和gag全长基因,测序得到40份gp120和41份gag基因序列,用GCG软件包等软件进行分析。结果河南省HIV-1毒株为B′亚型,新疆维吾尔自治区HIV-1毒株为CRF07 BC亚型。B′亚型毒株gp120基因中变异程度最大的区段是V5区段,最小的是C1区段;CRF07BC亚型毒株中变异最大的是V1区段,最小的是C4区段。两种亚型毒株gp120和gag基因的Ks/Ka值<1(P<0.05)。结论对于病毒基因全长序列的分析可以更多地反映病毒的特性。gp120基因各个区段在B′和CRF07BC亚型毒株中的变异程度不一致。B′和CRF07 BC亚型毒株的gp120基因和gag基因都受到正向选择压力的作用。 |
| 关 键 词： | 艾滋病病毒Ⅰ型 基因距离 选择压力 系统进化树 |
| 文章编号： | 1672-5662（2007）05-0405-04 |
| 修稿时间： | 2007-02-05 |
An analysis of gp120 and gag gene variation of HIV-1 strains isolated from Henan and Xinjiang in China |
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| SONG Yan-hui ,XING Hui, WANG Zhe,et al.. An analysis of gp120 and gag gene variation of HIV-1 strains isolated from Henan and Xinjiang in China[J]. Chinese JOurnal of Aids & STD, 2007, 13(5): 405-408 | |
| Authors: | SONG Yan-hui XING Hui WANG Zhe et al. |
| Affiliation: | Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Science, Wuhan , Hubei 430071, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | HIV-1 Gene distance Selective pressure Phylogenetic tree |
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