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基于网络药理学和分子对接技术探讨柴银颗粒抗冠状病毒感染潜在分子机制
引用本文:孙元芳,李冰冰,关永霞,叶士莉,严诗楷,支运霞,张贵民.基于网络药理学和分子对接技术探讨柴银颗粒抗冠状病毒感染潜在分子机制[J].中草药,2020,51(19):4999-5009.
作者姓名:孙元芳  李冰冰  关永霞  叶士莉  严诗楷  支运霞  张贵民
作者单位:上海交通大学药学院, 上海 200240;中药制药共性技术国家重点实验室, 山东 临沂 276000
基金项目:山东省重大科技创新工程项目(2017CXGC1308);山东省重大科技创新工程项目(2018CXGC1305)
摘    要:目的基于网络药理学和分子对接分析柴银颗粒抗冠状病毒感染的分子机制。方法从TCMSP数据库中获取柴银颗粒成分,其潜在靶点以及冠状病毒作用靶点分别利用SwissTargetPrediction数据库和GeneCards数据库获取。通过绘制韦恩图发现柴银颗粒抗冠状病毒感染的潜在药效成分和作用靶点。潜在药效成分-作用靶点网络和潜在作用靶点的互作网络可视化由Cytoscape 3.7.0软件完成。GO功能和KEGG通路分析在String数据库中进行。潜在药效成分和关键靶点的分子对接由autodock vina 1.1.2实现。结果发现了柴银颗粒抗冠状病毒感染的51个潜在药效成分和14个潜在作用靶点。生物信息学分析发现PI3K-Akt、IL-17等信号通路与柴银颗粒抗冠状病毒感染的分子机制相关。分子对接结果显示柴银颗粒中的黄芩苷等成分与NTRK2等靶点的亲和力强。结论柴银颗粒中的黄芩苷、荜澄茄素、黄连碱等作用于NTRK2、PRKCα、TNF等,调节PI3K-Akt/m TOR、Erb B/Ras和IL-17等信号通路抑制冠状病毒的侵袭和复制,增强宿主免疫能力,实现抗冠状病毒感染。

关 键 词:柴银颗粒  冠状病毒  网络药理学  分子对接  分子机制  黄芩苷  荜澄茄素  黄连碱
收稿时间:2020/7/14 0:00:00

Potential molecular mechanism for Chaiyin Granules against coronavirus infection based on network pharmacology and molecular docking
SUN Yuan-fang,LI Bing-bing,GUAN Yong-xi,YE Shi-li,YAN Shi-kai,ZHI Yun-xi,ZHANG Gui-min.Potential molecular mechanism for Chaiyin Granules against coronavirus infection based on network pharmacology and molecular docking[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2020,51(19):4999-5009.
Authors:SUN Yuan-fang  LI Bing-bing  GUAN Yong-xi  YE Shi-li  YAN Shi-kai  ZHI Yun-xi  ZHANG Gui-min
Institution:School of Pharmacy, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China;State Key Laboratory of Generic Manufacture Technology of Chinese Traditional Medicine, Linyi 276000, China
Abstract:
Keywords:Chaiyin Granules  coronavirus  network pharmacology  molecular docking  molecular mechanism  baicalin  cubebin  coptisine
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