| 细粒棘球绦虫TSP11基因在不同发育期的差异表达及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王炜烨,王云菲,陆宝燕,马勋,张艳艳,孟季蒙,王正荣,薄新文. 细粒棘球绦虫TSP11基因在不同发育期的差异表达及生物信息学分析[J]. 中国病原生物学杂志, 2020, 0(1): 25-31 |
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| 作者姓名： | 王炜烨 王云菲 陆宝燕 马勋 张艳艳 孟季蒙 王正荣 薄新文 |
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| 作者单位： | 石河子大学动物科技学院;省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划项目(973计划)(No.2015CB150300);国家自然科学基金项目(No.31860701,31360608);新疆生产建设兵团国际科技合作项目(No.2017BC003)。 |
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| 摘 要： | 目的研究细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus,Eg)TSP基因家族TSP11基因的分子特性及其在虫体不同发育期的差异表达,为细粒棘球绦虫疫苗的研发奠定基础。方法从NCBI GenBank数据库中获得TSP11基因序列并设计特异性引物,以Eg原头节RNA为模板进行RT-PCR。将PCR产物克隆到pMD19-T载体后测序,通过生物信息学软件分析预测TSP11基因编码蛋白的结构与功能;通过SYBR GreenⅠqRT-PCR检测TSP11基因在虫体原头蚴以及成虫mRNA相对转录情况。结果生物信息学分析TSP11基因全长765个核苷酸,编码蛋白含254个氨基酸,理论等电点为8.91,为稳定蛋白分子。编码TSP11基因的氨基酸序列共含有3个跨膜区域,推测含有7个优势B抗原表位,与已登录的细粒棘球绦虫TSP11序列(XP024352489.1)同源性为99.61%。qRT-PCR显示TSP11基因在原头蚴及成虫阶段均有表达,且表达水平差异无统计学义(P>0.05)。结论成功克隆了细粒棘球绦虫TSP11基因,该基因在Eg原头蚴及成虫期均有表达,其编码蛋白为稳点蛋白,含有B细胞抗原表位,为进一步揭示其分子生物学功能奠定了基础。
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| 关 键 词： | 细粒棘球绦虫 TSP11基因 差异表达 生物信息学 |
Differential expression and bioinformatic analysis of the TSP11 gene of Echinococcus granulosus at different developmental stages |
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| WANG Wei-Ye,WANG Yun-Fei,LU Bao-yan,MA Xun,ZHANG Yan-yan,MENG Ji-meng,WANG Zheng-rong,BO Xin-wen. Differential expression and bioinformatic analysis of the TSP11 gene of Echinococcus granulosus at different developmental stages[J]. Journal of Pathogen Biology, 2020, 0(1): 25-31 |
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| Authors: | WANG Wei-Ye WANG Yun-Fei LU Bao-yan MA Xun ZHANG Yan-yan MENG Ji-meng WANG Zheng-rong BO Xin-wen |
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| Affiliation: | (College of Animal Science and Technology,Shihezij China 832000;State Key Laboratory of Sheep Genetic Improvement and Healthy Breeding,Animal Husbandry and Veterinary Institute,Xinjiang Academy of Agricultural and Reclamation Sciences,Shiheziy China 832000) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Echinococcus granulosus TSP11 gene differential expression bioinformatics |
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