COPD动态miRNA表达谱的构建及生物信息学分析 |
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引用本文: | 谢丽华,孙圣华,卢俊娟,林桦. COPD动态miRNA表达谱的构建及生物信息学分析[J]. 基础医学与临床, 2016, 0(6): 739-746 |
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作者姓名: | 谢丽华 孙圣华 卢俊娟 林桦 |
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作者单位: | 中南大学湘雅三医院呼吸科,湖南长沙,410013 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(81500033) |
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摘 要: | 目的构建慢性阻塞性肺疾病(COPD)动态大鼠模型不同时期肺组织miRNA表达谱,并对差异表达的miRNAs进行生物信息学分析,以了解COPD发生发展中miRNAs变化规律及可能涉及相关机制。方法 1)将大鼠随机分为对照组、吸烟2、4、6、8周组和15周+气管内滴注猪胰弹性蛋白酶组,每组5只,病理学观察其形态学改变;2)取对照组、吸烟4周和15周+气管内滴注猪胰弹性蛋白酶组大鼠肺组织各2例,用于miRNA表达谱芯片分析;3)实时荧光定量PCR法验证芯片数据;4)运用生物信息学法对miRNA表达谱进行靶基因预测及聚类分析。结果 1)成功建立COPD动态大鼠模型,该鼠肺组织早期以出现炎性细胞浸润为主,晚期出现肺气肿改变的动态病理变化;2)成功建立miRNAs动态表达谱,熏烟4周组共30个miRNAs异常表达,熏烟15周组共37个miRNAs异常表达;3)实时荧光定量PCR法证实miR-146a、miR-21、miR-206和miR-181a变化趋势与芯片一致;4)生物信息学分析显示异常表达的miRNAs可能与COPD发病机制密切相关。结论 1)成功构建动态COPD大鼠模型及miRNA表达谱。2)通过生物信息学分析异常表达的miRNA可能在COPD发病机制中发挥重要作用。
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关 键 词: | 慢性阻塞性肺疾病 miRNA 微芯片 生物信息学 |
Construction of dynamic miRNA expression profiling and bioinformatics analysis in COPD |
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Abstract: | |
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Keywords: | chronic obstructive pulmonary disease (COPD) miRNA microarray bioinformatics |
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