| 利用同源序列确定人GIPC2核心启动子和寻找可能的顺式作用元件 |
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| 引用本文： | 程志凯,郑直.利用同源序列确定人GIPC2核心启动子和寻找可能的顺式作用元件[J].基础医学与临床,2016(5):688-693. |
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| 作者姓名： | 程志凯 郑直 |
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| 作者单位： | 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系,北京,100005 |
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| 摘 要： | 目的利用同源序列确定人GIPC2核心启动子区和寻找可能存在的基因调控区域。方法 1)利用Vista比对不同物种GIPC2基因编码区和非编码区序列,得到GIPC2同源序列;2)分别构建插入人和大鼠GIPC2翻译起始位点ATG上游不同长度截短片段的重组质粒,转染人HEK293T细胞和大鼠PC12细胞;3)根据报告基因荧光强度推断人和大鼠GIPC2的核心启动子区;4)将人GIPC2内含子区同源序列置于核心启动子前面,构建重组质粒,转染HEK293T,HT-29和PC12细胞,检测启动子活性。结果人GIPC2核心启动子区确定为+32至+190序列区域;人和大鼠GIPC2 ATG上游一段同源序列有抑制GIPC2启动子活性的功能;人和大鼠GIPC2第一个内含子内的同源序列有促进启动子活性的功能。结论利用同源序列方法确定了人GIPC2基因的核心启动子区,并且找到能抑制和促进GIPC2启动子活性的可能的顺式作用元件。
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| 关 键 词： | GIPC2 核心启动子区 同源序列 基因表达调控 |
Identification of human GIPC2 core promoter and potential cis-acting element using sequence homology approach |
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| Keywords: | GIPC2 core promoter homologous sequence gene expression regulation |
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