| 利用转录因子结合位点识别人类肿瘤特异性启动子研究 |
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| 引用本文： | 王琦,李伟鹏,黄仲曦,杨琳. 利用转录因子结合位点识别人类肿瘤特异性启动子研究[J]. 南方医科大学学报, 2004, 24(11): 1323-1325 |
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| 作者姓名： | 王琦 李伟鹏 黄仲曦 杨琳 |
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| 作者单位： | 1. 南方医科大学, 生物医学工程系, 广东, 广州, 510515;2. 南方医科大学, 病理教研室, 广东, 广州, 510515 |
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| 基金项目： | 收稿日期:2004-4-9。作者简介:王琦(1974- ),男,1997年毕业于第一军医大学,在读硕士研究生,电话:020-61648283,E-mail:king@fimmu.com |
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| 摘 要： | 目的 研究应用计算机技术对人类肿瘤特异性启动子进行识别、预测。方法 通过收集肿瘤特异性启动子序列、转录因子结合位点序列、非肿瘤启动子序列3种数据集合,利用转录因子结合位点在不同序列集合中的密度求出各位点的对应密度比,确定识别特征,进行肿瘤特异性启动子的识别。结论 该方法具有较高的准确性,在保证对训练集合90%以上的识别率的情况下,对测试集合的识别率达到80%以上。
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| 关 键 词： | 肿瘤 启动子识别 转录因子结合位点 |
| 文章编号： | 1000-2588(2004)11-1323-03 |
| 修稿时间： | 2004-04-09 |
Predicting human tumor-specific promoter using transcription factor binding sites |
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| WANG Qi,LI Wei-peng,HUANG Zhong-xi,YANG Lin. Predicting human tumor-specific promoter using transcription factor binding sites[J]. Journal of Southern Medical University, 2004, 24(11): 1323-1325 |
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| Authors: | WANG Qi LI Wei-peng HUANG Zhong-xi YANG Lin |
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| Affiliation: | WANG Qi1,LI Wei-peng1,HUANG Zhong-xi2,YANG Lin1 Department of Biomedical Engineering1,Department of Pathology2,Southern Medical University,Guangzhou 510515,China |
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| Keywords: | |
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