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基于生物信息学筛选纳米二氧化硅致肺纤维化关键因子题录
作者姓名:师凡  杨晓静  熊敏  杨玉姗  张艳淑  金玉兰
作者单位:华北理工大学公共卫生学院
基金项目:国家自然科学基金(81202161);
摘    要:目的构建巨噬细胞-成纤维细胞体外模型模拟肺纤维化过程, 探讨纳米二氧化硅(SiNPs)暴露致肺纤维化的关键机制。方法于2021年1月, 取对数生长期的人单核细胞白血病(THP-1)细胞, 分别采用0、25、50、100 μg/ml SiNPs处理24 h, 收集THP-1细胞上清液分别作用于对数生长期的对照组和低、中、高剂量组人胚肺成纤维(MRC-5)细胞, 继续培养24 h。检测不同组别MRC-5细胞增殖情况。检测MRC-5细胞上清液中细胞羟脯胺酸(Hyp)、白细胞介素6(IL-6)、白细胞介素1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)表达水平。检测高剂量组MRC-5细胞中的差异蛋白表达情况, 应用GeneCard数据库中肺纤维化相关蛋白对高剂量组MRC-5细胞进行差异肺纤维化蛋白的筛选。应用GO分析对高剂量组的差异肺纤维化蛋白进行富集分析, 应用String数据库构建高剂量组的差异肺纤维化蛋白的相互作用(PPI)网络, 使用CytoHubba软件筛选高剂量组的关键差异肺纤维化蛋白。使用Pearson相关分析计算关键差异肺纤维化蛋白之间的相关系数, Western blotti...

关 键 词:肺纤维化  纳米二氧化硅  生物信息学  基质金属蛋白酶9  基质蛋白酶组织抑制因子1  细胞外基质水解
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