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70 mer长寡核苷酸探针芯片制备、标记方法及杂交条件的优化
引用本文:庞靖祥,韩金祥,高雪芹,潘继红.70 mer长寡核苷酸探针芯片制备、标记方法及杂交条件的优化[J].医学分子生物学杂志,2008,5(1):11-15.
作者姓名:庞靖祥  韩金祥  高雪芹  潘继红
作者单位:山东省医药生物技术研究中心卫生部生物技术药物重点实验室,山东省现代医用药物与技术重点实验室,济南市,250062
基金项目:山东省科技攻关计划资助课题
摘    要:目的优化长片段寡核苷酸芯片制备、探针标记及杂交条件。方法通过直接标记方法优化芯片的点样浓度、点样后的固定方法。探索两种靶基因标记方法,并优化杂交液及各种杂交条件。结果采用70mer寡核苷酸探针,点样浓度在10μmol/L时就可获得满意的荧光强度。探针点样后37℃水合,然后在3600mJ条件下进行紫外交联固定效果最好。样品采用生物素间接标记较CY3直接标记信号强度强,成本相对低廉。优化出的杂交液成分:50%甲酰胺、5×SSC、0.5%SDS,杂交时间为8h,杂交温度为65℃。结论通过此试验优化了制备病原体长探针寡核苷酸芯片的制备方法,样品标记策略和杂交液及杂交温度,为下一步制备多种病原体的寡核苷酸芯片检测系统奠定了基础。

关 键 词:寡核苷酸探针  基因芯片  条件优化
修稿时间:2007年10月19

Optimization of Hybridization Condition of 70 mer Oligonucleotide Probe Microarrays
PANG Jingxiang,HAN Jinxiang,GAO Xueqin,PAN Jihong.Optimization of Hybridization Condition of 70 mer Oligonucleotide Probe Microarrays[J].Journal of Medical Molecular Biology,2008,5(1):11-15.
Authors:PANG Jingxiang  HAN Jinxiang  GAO Xueqin  PAN Jihong
Abstract:
Keywords:oligonueleotide probe  gene chip  target gene labeling  optimization of condition
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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