| 宁波市肠道病毒71型分离株全基因序列对比分析 |
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| 引用本文： | 顾文珍,董红军,倪红霞,张姝,易波,杨天池,谢蕾,许国章.宁波市肠道病毒71型分离株全基因序列对比分析[J].中国公共卫生,2012,28(9):1236-1239. |
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| 作者姓名： | 顾文珍 董红军 倪红霞 张姝 易波 杨天池 谢蕾 许国章 |
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| 作者单位： | 宁波市疾病预防控制中心病毒研究所,浙江,315010 |
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| 基金项目： | 浙江省卫生厅医药卫生科学研究基金资助项目，宁波市科技局资助项目 |
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| 摘 要： | 目的探讨浙江宁波地区2010年分离的肠道病毒71型(EV71)中神经毒性相关位点。方法采集宁波地区2010年手足口病不同症状患者粪便标本,进行荧光聚合酶链反应检测,阳性标本病毒分离;分8个片段对EV71全基因序列和VP1区进行逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)、克隆、测序、拼接、同源性比较,用DNAstar推导其内含子编码的氨基酸序列并比对分析。结果 6株分离株基因全长均为7 406 bp,核苷酸同源性为97.9%～99.4%,其中3株死亡病例标本内部核糖体进入位点(IRES)中的124、272及408位,碱基分别为T、G、A,区别于其他3株手足口轻症患者分离株的A、A和G;3株死亡病例标本位于主要衣壳蛋白VP1区的第715位氨基酸和3C蛋白酶的第1 704位及1 706位的氨基酸分别为甲硫氨酸(met)、精氨酸(arg)及异亮氨酸(ile),区别于3株轻症病例的亮氨酸(leu)、赖氨酸(lys)及缬氨酸(val)。结论宁波地区2010年分离的EV71 IRES、VP1与3C位点变异与EV71神经毒性相关。
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| 关 键 词： | 肠道病毒71(EV71)型 全基因序列 同源性 |
Sequence analysis of enterovirus 71 strains isolated from patients with different clinical symptoms in Ningbo city |
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| Institution: | GU Wen-zhen,DONG Hong-jun,NI Hong-xia,et al(Institute of Virology,Ningbo Municipal Center for Disease Control and Prevention,Ningbo,Zhejiang Province 315010,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | EV71 genome homology |
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