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生物信息学揭示m7G甲基化修饰相关基因在腹主动脉瘤中的作用
作者姓名:叶嘉民  杨馨悦  刘继涛  马文韬  何彩云  杨帆  罗淞元  罗建方
作者单位:1. 华南理工大学医学院;2. 南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院);3. 广东省心血管病研究所广东省人民医院(广东省医学科学院)心内科;4. 南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院)急危重症医学科
基金项目:国家自然科学基金项目(项目编号:82070478);
摘    要:目的 明确N7-甲基鸟苷(7-methylguanosine,m7G)相关基因对腹主动脉瘤(abdominal aortic aneurysm,AAA)的作用。方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中获取人类AAA和正常组织中m7G相关基因的表达数据,并进行差异分析。通过LASSO回归筛选与发病相关的基因并进行免疫浸润分析,根据其表达模式对AAA患者进行共识聚类分型,对两种亚型的差异基因进行基因本体论(gene ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。最后通过数据库预测筛选出的m7G相关基因的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、微小RNA(microRNA,miRNA)。结果 筛选出6个具有显著差异的m7G相关基因,其中IFIT5、NUDT10和NUDT4与AAA发病密切相关。这三者其可能影响CD4幼稚T细胞,自然杀伤(natural killer,NK)细胞,Tregs细胞的免疫浸润程度,根据其表达模式聚类的...

关 键 词:腹主动脉瘤  N7-甲基鸟苷修饰  IFIT5  NUDT10  NUDT4
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