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大规模测序研究CD_(34)~ 造血干/祖细胞基因表达谱
引用本文:吴济生,张庆华,叶珉,吴昕彦,周隽,傅刚,黄秋花,顾健,包其郁,余亚平,沈宇,徐淑华,茅矛,陈竺. 大规模测序研究CD_(34)~ 造血干/祖细胞基因表达谱[J]. 中华血液学杂志, 2000, 0(5)
作者姓名:吴济生  张庆华  叶珉  吴昕彦  周隽  傅刚  黄秋花  顾健  包其郁  余亚平  沈宇  徐淑华  茅矛  陈竺
基金项目:国家 8 63高科技项目 !( 10 2 10 0 1 0 2 ),上海市科委及上海血研所胡应洲基金
摘    要:目的 建立大规模测序方法 ,并用于造血干 祖细胞 (HSPC)基因表达谱的初步识别。方法 从脐血中分离CD34 细胞 ,构建cDNA文库 ,对其进行大规模表达序列标签 (EST)测序 ,用生物信息学的方法进行结果分析。结果 在获得的 986 6条EST中 ,有意义序列归并为 2 0 6 0个连续克隆 ,其中10 5 4个为已知基因 ,10 0 6个为至今尚未被公共数据库公布的新基因片段。 10 5 4个已知基因根据功能分为八个大类 :①造血相关的 73个 ;②染色体结构及细胞分裂相关的 91个 ;③细胞信号传导相关的111个 ;④细胞结构 运动相关的 48个 ;⑤细胞和机体防御相关的 41个 ;⑥基因表达 (转录、翻译及加工 )相关的 2 6 5个 ;⑦代谢相关的 192个 ;⑧未分类的 2 33个。结论 获得了HSPC表达的 10 5 4个已知基因和 10 0 6个新基因片段构成的初步基因表达谱 ,为进一步深入研究造血基因表达调控和克隆新基因奠定了基础

关 键 词:造血干细胞  序列分析  基因表达  计算生物学

Exploration of gene expression profiles of CD_(34)~ hematopoietic stem/progenitor cells based on large scale sequencing
WU Jisheng,ZHANG Qinghua,YE Min,et al.. Exploration of gene expression profiles of CD_(34)~ hematopoietic stem/progenitor cells based on large scale sequencing[J]. Chinese Journal of Hematology, 2000, 0(5)
Authors:WU Jisheng  ZHANG Qinghua  YE Min  et al.
Affiliation:WU Jisheng,ZHANG Qinghua,YE Min,et al. Key Laboratory for Human Genome Research and Shanghai Institute of Hematology,Ruijin Hospital,Shanghai Second Medical University,Shanghai 200025,China
Abstract:
Keywords:Hematopoietic stem cell  Sequencing analysis  Gene expression profile  Computational biology
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