| 尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性CTL表位的预测、筛选及鉴定 |
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| 引用本文： | 赵金华,黄路,陈文昭,曹凯,安洪,袁铿,舒勇,黄山虎,廖翔,张战民,邓高荣.尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性CTL表位的预测、筛选及鉴定[J].免疫学杂志,2010(1). |
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| 作者姓名： | 赵金华 黄路 陈文昭 曹凯 安洪 袁铿 舒勇 黄山虎 廖翔 张战民 邓高荣 |
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| 作者单位： | 南昌大学第一附属医院骨科;江西省妇幼保健院儿童保健科;重庆医科大学附属第一医院骨科;江西省医学科学研究所肿瘤免疫室;南昌大学第一附属医院肿瘤科;南昌大学第四附属医院骨科; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30760254) |
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| 摘 要： | 目的预测、筛选及合成尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性细胞毒性T淋巴细胞(Cytotoxic T Lymphocyte,CTL)表位,初步鉴定EWS-FLI1表位肽。方法综合运用BIMAS、SYFPEITHI、Predep和IEDB方案对EWS-FLI1蛋白进行HLA-A~*0201限制性CTL表位的预测,应用多项式方案、量化基序方案对预测的CTL表位进行筛选,并将筛选的CTL表位与HLA-A~*0201分子进行动力学模拟,应用标准Fmoc方案合成CTL表位肽;通过表位多肽刺激CTL释放颗粒溶素的检测,以及靶细胞杀伤实验验证表位多肽的免疫效应。结果综合预测得出了8个可能的表位肽,进一步筛选确定其中4个肽为候选合成表位,应用分子动力模拟初步验证了4个候选表位肽与HLA-A2.1分子的结合力,合成的各条肽经色谱分析纯度均在98%以上,经质谱分析各肽的分子量测定值与理论值相符,颗粒溶素释放实验及靶细胞杀伤实验证实了筛选的表位均能产生刺激效应,其中,表位肽QIQLWQFLL(EWS-FLI1 304)的刺激效应最为显著。结论综合运用多个方案可提高预测效率,分子动力学模拟可初步验证表位肽与HLA-A~*0201的结合力,所合成的多肽为高纯度肽,通过免疫学实验初步鉴定了EWS-FLI1的表位。
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| 关 键 词： | CTL表位 多肽合成 尤文肉瘤 EWS-FLI1 分子动力模拟 |
Prediction,screening,and identification of HLA-A2.1-restricted CTL epitopes derived from Ewing's sarcoma EWS-FLI1 fusion protein |
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| ZHAO Jinhua,HUANG Lu,CHEN Wenzhao,CAO Kai,AN Hong,YUAN Keng,SHU Yong,HUANG Shanhu,LIAO Xiang,ZHANG Zhanmin,DENG Gaorong.Prediction,screening,and identification of HLA-A2.1-restricted CTL epitopes derived from Ewing's sarcoma EWS-FLI1 fusion protein[J].Immunological Journal,2010(1). |
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| Authors: | ZHAO Jinhua HUANG Lu CHEN Wenzhao CAO Kai AN Hong YUAN Keng SHU Yong HUANG Shanhu LIAO Xiang ZHANG Zhanmin DENG Gaorong |
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| Institution: | ZHAO Jinhua,HUANG Lu,CHEN Wenzhao,CAO Kai,AN Hong,YUAN Keng,SHU Yong,HUANG Shanhu,LIAO Xiang,ZHANG Zhanmin,DENG Gaorong Department of Orthopedics,First Affiliated Hospital of Nanchang University,Nanchang 330006,China |
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| Abstract: | EWS-FLI1 fusion protein expressed in Ewing's sarcoma(ES) is a new therapeutical target for ES treatment.The aim of this study is to predict and screen the HLA-A2.1-restricted CTL epitopes of Ewing's sarcoma EWS-FLI1 fusion protein,and to primarily identify the predicted HLA-A2.1-restricted CTL epitope candidates.The HLA-A2.1-restricted CTL epitopes of EWS-FLI1 fusion protein were synthetically predicted by BIMAS,SYFPEITHI,Predep and IEDB methods,and then screened by the polynomial and quantitative motif met... |
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| Keywords: | CTL epitope Polypeptide synthesis Ewing's sarcoma EWS-FLI1 Molecular dynamics simulation |
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