广西HIV-1 CRF01-AE env和gag区快速基因分型方法的建立 |
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引用本文: | 罗皓,梁浩,邵一鸣,张志勇,刘伟,邢辉,沈菁. 广西HIV-1 CRF01-AE env和gag区快速基因分型方法的建立[J]. 现代预防医学, 2010, 37(7) |
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作者姓名: | 罗皓 梁浩 邵一鸣 张志勇 刘伟 邢辉 沈菁 |
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作者单位: | 1. 广东医学院公共卫生学院,东莞,523808 2. 广西医科大学 3. 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防与控制中心病毒免疫室 4. 广西区疾病预防控制中心 |
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摘 要: | [目的]建立一种快速简便的基因分型方法,对广西HIV-1 CRF01-AE毒株env和gag基因区进行亚型鉴定。[方法]从HIV阳性样品中提取核酸,使用HIV-1M组通用引物对env和gag基因区进行第一轮扩增,第二轮则使用CRF01-AE亚型的特异性引物进行扩增,根据扩增的目的带位置来判断亚型。将通用引物扩增出的所有样本进行基因测序以验证结果。[结果]43份CRF01-AE样本中,经env基因区亚型特异性引物PCR法检测得出39份(90.70%),灵敏度为90.70%,而gag基因区亚型特异性引物PCR法检测得出42份(97.34%),灵敏度为97.34%。将基因测序法和亚型特异性引物PCR法的检测结果进行比较,经差异性检验显示两种方法检测结果在两基因区中差异均无统计学意义,env基因区两方法检测结果结果一致者占90.70%。而gag基因区则高达97.34%。重复实验显示env基因区平均重复性为93.80%(61/65),gag基因区为98.30%(59/60)。[结论]该方法是一种简便、快速、低成本,具有高度灵敏性和特异性的HIV-1 CRF01-AE env和gag基因区分型法,能够直接对广西HIV-1 CRF01-AE重组毒株进行鉴定。
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关 键 词: | 人类免疫缺陷病毒1型 基因型 聚合酶链反应 |
DEVELOPMENT OF A RAPID SUBTYPE-SCREENING ASSAY FOR THE ENV AND GAG REGION OF HIV-1 CRF01-AE STRAINS IN GUANGXI |
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