| hsa-miR-1908上游启动子区的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 匡仟卉柠,李景云,季晨博,郭锡镕,倪毓辉,徐美玉. hsa-miR-1908上游启动子区的生物信息学分析[J]. 临床儿科杂志, 2014, 0(4): 379-383 |
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| 作者姓名： | 匡仟卉柠 李景云 季晨博 郭锡镕 倪毓辉 徐美玉 |
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| 作者单位： | 1.南通大学附属医院儿科（江苏南通 226001）； 2.南京医科大学附属南京妇幼保健院医学研究中心（江苏南京 210011）； 3.南京医科大学儿科研究所（江苏南京 210029） |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(项目编号：81100618) |
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| 摘 要： | 目的利用各种生物信息学工具预测hsa-miR-1908上游启动子功能,以进一步研究其在人脂肪细胞中的转录调控机制。方法应用Ensemble数据库获取hsa-miR-1908上游启动子序列,利用多种在线相关软件预测出甲基化部位和转录因子结合部位。结果获取hsa-miR-1908上游启动子序列全长1 458 bp。miR-1908启动子序列中CpG岛位于(438~756)bp、(836~937)bp、(979~1374)bp处,CpG岛的存在会抑制miR-1908启动子的转录。miR-1908有15个转录因子的结合位点。结论 miRNA启动子相关生物信息学的研究,提高对启动子的研究效率,为进一步研究miR-1908的转录调控机制提供了重要的信息。
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| 收稿时间： | 2013-12-07 |
Bioinformatic analysis of the hsa-miR-1908 upstream promoter region |
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| KUANG Qian huining,LI Jingyun,JI Chenbo,GUO Xirong,NI Yuhui,XU Meiyu. Bioinformatic analysis of the hsa-miR-1908 upstream promoter region[J]. The Journal of Clinical Pediatrics, 2014, 0(4): 379-383 |
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| Authors: | KUANG Qian huining LI Jingyun JI Chenbo GUO Xirong NI Yuhui XU Meiyu |
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| Affiliation: | (1.Department of Pediatrics, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong 226001, Jiangsu, China; 2.Nanjing Maternity and Child Health Care Hospital Affiliated to Nanjing Medical University, Nanjing 210011, Jiangsu, China; 3.Institue of Pediatrics, Nanjing Medical University, Nanjing 210029, Jiangsu, China) |
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| Abstract: | |
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