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| 戊型肝炎病毒基因ORF1、ORF2阳性选择分析 | |
| 引用本文： | 邵中军,李晶华,范俊,郑英杰,熊成龙,姜庆五,孙静,栗燕,杨林.戊型肝炎病毒基因ORF1、ORF2阳性选择分析[J].中国公共卫生,2009,25(4). |
| 作者姓名： | 邵中军 李晶华 范俊 郑英杰 熊成龙 姜庆五 孙静 栗燕 杨林 |
| 作者单位： | 1. 第四军医大学预防医学系流行病学教研室,陕西西安,710032 2. 第四军医大学西京医院中医科 3. Faculty of Life Science,University of Manchester,UK,M139P 4. 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，中国博士后科学基金 |
| 摘 要： | 目的 探讨戊型肝炎病毒基因2个主要读码框(ORF)1、(ORF)2是否存在阳性选择位点.方法 P P收集戊型肝炎基因全序列,利用MEGA 3.0软件进行序列比对,校对密码子.PHYLIP 3.6构建NJ进化树,PAML4.0分析阳性选择位点.结果 平均进化率估计提示ORF1、ORF 2均以净化选择为主,平均ω分别为0.029,0.024;中性进化模型显示有ORF 1有93%的位点属于保守位点.平均ω=0.018;ORF 2有98%的位点属于保守位点,平均ω=0.018;阳性选择模型分析结果提示ORF 1、ORF 2没有阳性选择位点.结论 HEV进化过程中可能不存在阳性选择的进化模式. |
| 关 键 词： | 戊型肝炎病毒 阳性选择 病毒基因 |
Positive selection of ORFI and ORF2 in hepatitis E virus genome |
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| Abstract: | |
| Keywords: | |
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