| 红白忍冬SABATH甲基转移酶基因克隆及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 余晓丹,蒋超,黄璐琦,秦双双,曾祥梅,陈平,袁媛. 红白忍冬SABATH甲基转移酶基因克隆及其生物信息学分析[J]. 中国中药杂志, 2013, 38(16): 2556-2562 |
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| 作者姓名： | 余晓丹 蒋超 黄璐琦 秦双双 曾祥梅 陈平 袁媛 |
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| 作者单位： | 武汉工业学院, 湖北 武汉 430023;中国中医科学院 中药资源中心, 北京 100700;中国中医科学院 中药资源中心, 北京 100700;中国中医科学院 中药资源中心, 北京 100700;中国中医科学院 中药资源中心, 北京 100700;中国中医科学院 中药资源中心, 北京 100700;武汉工业学院, 湖北 武汉 430023;中国中医科学院 中药资源中心, 北京 100700 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(81001605);中药制药过程新技术国家重点实验室开放基金项目(SKL2010M0101) |
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| 摘 要： | 目的: 克隆红白忍冬SABATH甲基转移酶基因(rLjSABATHMT),比较忍冬和红白忍冬SABATH甲基转移酶同源基因表达量和基因内含子序列的差异,为金银花的活性成分形成及调控机制研究提供基础。方法: 根据cDNA文库提供的基因片段设计特异性引物,从红白忍冬中克隆获得rLjSABATHMT基因cDNA序列及基因组序列。通过生物信息学对该基因蛋白的特征进行分析,使用MEGA 5.0构建SABATH甲基转移酶系统进化树,利用RT-PCR分析SABATHMT同源基因在忍冬与红白忍冬的不同器官、不同花期的表达量,对忍冬和红白忍冬SABATHMT同源基因内含子区序列进行分析和比较。结果: 克隆获得的rLjSABATHMT基因cDNA序列全长为1 251 bp,具有完整编码框,编码365个氨基酸。该基因蛋白序列具有保守的SABATHMT结构域,系统进化树结果表明它可能是水杨酸/安息酸甲基转移酶。基因表达分析结果表明SABATHMT同源基因主要在花中表达。忍冬和红白忍冬SABATHMT同源基因内含子区序列具有丰富的多态性,且有2个SNP为红白忍冬的特有基因型;内含子区motif元件中碱基变异在2个同源基因间具有显著差异。结论: SABATHMT同源基因内含子区变异可能导致了忍冬和红白忍冬SABATH甲基转移酶表达差异,为金银花活性成分调控机制研究提供了重要研究基础。
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| 关 键 词： | 金银花 SABATH甲基转移酶 全长cDNA 内含子 |
| 收稿时间： | 2012-11-02 |
Gene cloning and bioinformatics analysis of SABATH methyltransferase in Lonicera japonica var. chinensis |
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| YU Xiao-dan,JIANG Chao,HUANG Lu-qi,QIN Shuang-shuang,ZENG Xiang-mei,CHEN Ping and YUAN Yuan. Gene cloning and bioinformatics analysis of SABATH methyltransferase in Lonicera japonica var. chinensis[J]. China Journal of Chinese Materia Medica, 2013, 38(16): 2556-2562 |
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| Authors: | YU Xiao-dan JIANG Chao HUANG Lu-qi QIN Shuang-shuang ZENG Xiang-mei CHEN Ping YUAN Yuan |
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| Affiliation: | Wuhan Polytechnic University, Wuhan 430023, China;National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;Wuhan Polytechnic University, Wuhan 430023, China;National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Lonicera japonica SABATH methyltransferases full-length cDNA intSron |
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