| 摘 要： | 目的了解江苏省腹泻患者临床分离耶尔森菌的分布特点及分子特征。方法 2017-2021年, 在小肠结肠炎耶尔森菌国家级主动监测点江苏省徐州市铜山区和盐城市东台市, 采集腹泻患者粪便标本, 进行耶尔森菌菌株分离;同时, 收集全省哨点医院疑似耶尔森菌菌株。提取分离菌株DNA进行全基因组重测序, 并上传至EnteroBase数据库进行耶尔森菌种型鉴定, 原始数据经清洁和处理后进行16S核糖体RNA(16S rRNA)基因多态性分析;通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)和病原菌毒力因子数据库(VFDB)扫描5种毒力基因(ail、ystA、ystB、yadA、virF)携带情况, 同时构建K-mer树并进行基因组特征分析。结果 2017-2021年, 共采集腹泻患者粪便标本2 058份, 经分离鉴定, 得到57株耶尔森菌;同时, 通过哨点医院收集到2株耶尔森菌。经EnteroBase数据库比对, 51株菌为小肠结肠炎耶尔森菌, 4株菌为Yersinia proxima, 阿利克西奇耶尔森菌、马赛耶尔森菌、中间耶尔森菌及Yersinia canariae各1株。16S rRNA基因多态性分析显示...
|
