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5-氟尿嘧啶介导氧化应激治疗结肠癌的关键基因筛选
引用本文:杨丰帅,彭玲,邱东达,杨运泉,陈石林,周厚吾.5-氟尿嘧啶介导氧化应激治疗结肠癌的关键基因筛选[J].南昌大学学报(医学版),2023(4):73-79.
作者姓名:杨丰帅  彭玲  邱东达  杨运泉  陈石林  周厚吾
作者单位:1. 长沙市第一医院胃肠外科;2. 长沙市第一医院外科护理
摘    要:目的 探究5-氟尿嘧啶(5-FU)介导氧化应激治疗结肠癌的关键基因。方法 从GSE193865和GSE164742数据集中筛选5-FU介导氧化应激治疗结肠癌的共同差异基因(DEGs),并对共同DEGs进行功能富集,构建PPI网络筛选关键基因。基于TCGA数据集和GSE164742数据集,分析关键基因在结肠癌中的表达、相关性及其与预后的关系。利用分子对接实验验证5-FU对关键基因的靶向作用。结果 筛选出29个共同DEGs;这29个基因在功能上与P53信号通路、细胞周期等6条信号通路和有丝分裂细胞周期过程、微管等10项功能有关。PPI网络分析筛选得到7个关键基因(AURKA、CDCA8、CCNB1、KIF14、SPAG5、BUB1B和KIF20A);这7个关键基因均在结肠癌中高表达,且5-FU可显著抑制结肠癌细胞中这7个关键基因的高表达(均P<0.05);在TCGA和GSE193865数据集中这7个关键基因的表达之间均具有较好的相关性(r>0.6,均P<0.05)。这7个关键基因的高表达与结肠癌患者总体生存不良密切相关(Logrank P<0.05)。5-FU与这7...

关 键 词:5-氟尿嘧啶  结肠癌  氧化应激  生物信息学  关键基因
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