5-氟尿嘧啶介导氧化应激治疗结肠癌的关键基因筛选 |
| |
引用本文: | 杨丰帅,彭玲,邱东达,杨运泉,陈石林,周厚吾.5-氟尿嘧啶介导氧化应激治疗结肠癌的关键基因筛选[J].南昌大学学报(医学版),2023(4):73-79. |
| |
作者姓名: | 杨丰帅 彭玲 邱东达 杨运泉 陈石林 周厚吾 |
| |
作者单位: | 1. 长沙市第一医院胃肠外科;2. 长沙市第一医院外科护理 |
| |
摘 要: | 目的 探究5-氟尿嘧啶(5-FU)介导氧化应激治疗结肠癌的关键基因。方法 从GSE193865和GSE164742数据集中筛选5-FU介导氧化应激治疗结肠癌的共同差异基因(DEGs),并对共同DEGs进行功能富集,构建PPI网络筛选关键基因。基于TCGA数据集和GSE164742数据集,分析关键基因在结肠癌中的表达、相关性及其与预后的关系。利用分子对接实验验证5-FU对关键基因的靶向作用。结果 筛选出29个共同DEGs;这29个基因在功能上与P53信号通路、细胞周期等6条信号通路和有丝分裂细胞周期过程、微管等10项功能有关。PPI网络分析筛选得到7个关键基因(AURKA、CDCA8、CCNB1、KIF14、SPAG5、BUB1B和KIF20A);这7个关键基因均在结肠癌中高表达,且5-FU可显著抑制结肠癌细胞中这7个关键基因的高表达(均P<0.05);在TCGA和GSE193865数据集中这7个关键基因的表达之间均具有较好的相关性(r>0.6,均P<0.05)。这7个关键基因的高表达与结肠癌患者总体生存不良密切相关(Logrank P<0.05)。5-FU与这7...
|
关 键 词: | 5-氟尿嘧啶 结肠癌 氧化应激 生物信息学 关键基因 |
|
|