miR-146b靶标预测及功能分析 |
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引用本文: | 朱玲玲,史春梅,徐广峰,张春梅,陈玲,季晨博,郭锡熔,鲁一兵.miR-146b靶标预测及功能分析[J].江苏医药,2013,39(3):266-268. |
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作者姓名: | 朱玲玲 史春梅 徐广峰 张春梅 陈玲 季晨博 郭锡熔 鲁一兵 |
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作者单位: | 1. 南京医科大学第二附属医院内分泌病科,江苏省,210011 2. 南京医科大学儿科研究所 3. 南京医科大学附属南京妇幼保健院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(81100619);江苏省医学创新团队项目(LJ201108);江苏省自然科学基金(BK2011107);南京市科技发展计划(201104013) |
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摘 要: | 目的 通过对miR-146b进行系统的生物信息学分析,预测miR-146b的靶基因及其功能.方法 应用miRBase获取并分析miR-146b的序列特征;应用TargetScan、PicTar及miRanda预测miR-146b的靶基因,进行功能注释和信号转导通路分析;应用PubMed、Google等信息搜索工具综述miR-146b已有功能研究.结果 miR-146b在各物种之间具有高度保守性.功能注释显示预测靶基因主要富集于促细胞增殖、转录调控、调控细胞分化等生物学过程.信号转导通路分析显示预测靶基因显著富集于白血病、ErbB信号通路、促分裂原活化的蛋白激酶通路等.结论 生物信息学分析提示,miR-146b可能与细胞分化、代谢密切相关.
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关 键 词: | miR-146b miRNA 生物信息学 人脂肪细胞 |
Bioinformatics analysis of target prediction and function of miR-146b |
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Institution: | ZHU Lingling,SHI Chunmei,XU Guangfeng,et al.Department of Endocrinology,Second Affiliated Hospital,Nanjing Medical University,Nanjing 210011,CHINA |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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