| 胰腺癌干细胞差异基因的表达及生物信息学分析 |
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| 作者姓名： | 江建新 高珊 王敏 李旭 孙诚谊 |
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| 作者单位： | 贵阳医学院附属医院肝胆外科;贵阳医学院附属医院消化内科;华中科技大学同济医学院附属同济医院胆胰外科中心 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目,No.81160311;贵州省科技厅贵阳医学院社发联合基金资助项目,No.黔科合[2010]3171;贵阳市科技局基金资助项目,No.筑科合[2011103]22号;贵州省肝胰疾病研究科技创新人才团队项目基金资助项目,No.黔科合人才团队[2010]4010~~ |
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| 摘 要： | 目的:筛选与胰腺癌干细胞相关的差异表达基因,并进行生物信息学分析.方法:以MIA-PaCa2(TIChigh)与BxPc-3(TIClow)为研究胰腺癌干细胞的工具细胞制备总RNA,经质量鉴定后进行荧光标记;采用Agilent人全基因4*44K芯片进行杂交实验,获得mRNA表达谱;以Gene Spring Software 11.0软件和Quantile算法分析芯片实验数据,筛选与胰腺癌干细胞相关的差异mRNAs;基于Gene Ontology数据库进行GO注释,基于KEGG数据库进行Pathway注释.结果:获得符合基因芯片实验质量标准的RNA样品,基因芯片杂交及数据分析得到差异表达mRNAs 7059个(P<0.05,fold change≥2),其中MIA-PaCa2(TIChigh)中上调表达3440个,下调表达3619个.GO注释显示他们主要涉及多胺代谢过程、含碱基的小分子相互转换、组蛋白H4乙酰化、细胞分裂、细胞周期、凋亡、Toll样受体信号转导通路等.Pathway注释主要涉及癌症的途径、内吞作用、O-糖基化生物合成、嘧啶代谢、谷胱甘肽代谢等.信号通路调控网络图显示多条信号通路存在交叉对话.结论:筛选出的差异表达基因可能参与胰腺癌干细胞的发生发展,参与不同信号通路的调控,并有可能成为胰腺癌新的治疗靶点.
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| 关 键 词： | 胰腺癌 干细胞 基因芯片 生物学信息 |
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