基于SSR分子标记的柴胡遗传多样性与遗传结构分析

为探究柴胡遗传多样性和居群遗传结构,揭示柴胡的遗传变异情况,本研究利用18对SSR分子标记,对来自山西及周边省份的62个柴胡栽培和野生居群共619个植株进行遗传多样性以及居群遗传结构分析。结果显示:62个柴胡居群均具有较高的遗传多样性,柴胡野生居群的遗传多样性高于栽培居群, AMOVA分析表明柴胡居群内遗传变异大于居群间的变异。主坐标分析将柴胡居群分为3类,第一类为来自山西各地的野生柴胡居群,第二类由来自山西、河北、陕西、辽宁的栽培柴胡居群组成,第三类由来自山西和甘肃的34个栽培柴胡居群组成。STRUCTURE软件居群遗传结构分析预测62个柴胡居群的最佳分组数为2组,第一组组成与主坐标分析中分类为第三类的居群相同,第二组则包括有主坐标分析中划分为第一类和第二类的居群。主坐标分析、居群遗传结构分析以及NJ树聚类均将野生柴胡居群聚为一类,使其与栽培居群区分开来。本研究为柴胡的种质资源利用、遗传变异研究以及柴胡优质种质资源开发提供理论依据。