肠道病毒71型VP1外壳蛋白二级结构及B细胞表位预测 |
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引用本文: | 蒋建平,王来,李宜川,高明灿.肠道病毒71型VP1外壳蛋白二级结构及B细胞表位预测[J].山东医药,2009,49(35):10-12. |
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作者姓名: | 蒋建平 王来 李宜川 高明灿 |
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作者单位: | 商丘医学高等专科学校基础医学部,河南商丘,476100 |
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基金项目: | 河南省教育厅自然科学研究计划项目 |
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摘 要: | 目的预测肠道病毒71型(EV71)外壳蛋白VP1二级结构和B细胞表位,为制备EV71疫苗的研究提供理论基础。方法应用GOR4、HNN、SOPMA、nnPredict等方法预测EV71 VP1二级结构,并结合亲水性、柔韧性、表面可能性和吴氏抗原指数法综合预测潜在的B细胞表位。结果EV71 VP1二级结构以无规卷曲和β-片层为主,含有少量的α-螺旋,少见β-转角;EV71 VP1潜在的B细胞表位很可能位于第67-71位氨基酸残基。结论联合多种生物信息学方法成功预测了EV71 VP1二级结构和B细胞表位;此为制备EV71疫苗的研究提供了理论基础。
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关 键 词: | 手足口病 肠道病毒VP1 二级结构 B细胞表位 |
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