| 基因芯片技术在乙肝病毒基因型及YMDD变异检测中的应用 |
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| 引用本文： | 陈伟烈,蔡晓莉,魏绍静,杨湛,刘国莲,唐小平. 基因芯片技术在乙肝病毒基因型及YMDD变异检测中的应用[J]. 中国实验诊断学, 2007, 11(2): 207-212 |
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| 作者姓名： | 陈伟烈 蔡晓莉 魏绍静 杨湛 刘国莲 唐小平 |
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| 作者单位： | 广州市第八人民医院,传染病研究所,广东,广州,510060 |
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| 摘 要： | 目的评价基因芯片技术在HBV基因型及HBVP基因YMDD变异检测中的应用价值,并对不同基因型病例的临床情况进行分析。方法抽提HBV DNA,用PCR方法扩增S基因及P基因部分区域,扩增产物与基因芯片上的寡核苷酸探针进行杂交,杂交结果通过芯片影像读取仪扫描到计算机上,经软件分析可得到HBV基因型、HBVYMDD野生型及YVDD、YIDD变异型结果;部分标本通过HBV preS/S基因序列测序证实。结果38份高病毒滴度标本(HBV DNA定量>1.0×105拷贝/毫升)中22例为B基因型(58%),16例为C基因型(42%);32例为HBV YMDD野生型,2例为YVDD变异型、4例为YIDD变异型。临床情况方面,无症状携带者中有2例为基因型B、3例为基因型C,慢乙肝患者中有16例为基因型B1、2例为基因型C,肝硬化患者中有4例为基因型B、1例为基因型C;B型和C型患者e抗原阳性率分别为54.5%(12/22)和87.5%(14/16)。10份HBV DNA定量<1.0×105拷贝/毫升的标本不能检测出HBV基因型及YMDD变异情况。11例阳性标本的基因测序结果与基因芯片检测结果一致。结论(1)基因芯片检测HBV基因型及HBV P基因区YMDD变异准确性高、特异性好,同时每次实验得到的信息量多,适合于临床开展应用,但需提高灵敏度;(2)C基因型乙肝患者HBV e抗原阳性率高于B型患者。
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| 关 键 词： | 肝炎病毒 乙型 基因芯片 基因型 YMDD变异 |
| 文章编号： | 1007-4287（2007）02-0207-06 |
| 收稿时间： | 2006-06-09 |
| 修稿时间： | 2006-06-09 |
Application of gene chip technique in the detection of HBV genotypes and YMDD mutations |
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| CHEN Wei-lie,CAE Xiao-li,WEI Shao-jing et al.. Application of gene chip technique in the detection of HBV genotypes and YMDD mutations[J]. Chinese Journal of Laboratory Diagnosis, 2007, 11(2): 207-212 |
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| Authors: | CHEN Wei-lie CAE Xiao-li WEI Shao-jing et al. |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hepatitis B virus gene chips genotypes YMDD Mutatiom |
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