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应用基因芯片技术筛选曲古菌素A诱导肺腺癌耐药细胞株A549/CDDP差异表达的凋亡基因
引用本文:汪亚君,张海涛,熊禹真,刘彬,伍俊.应用基因芯片技术筛选曲古菌素A诱导肺腺癌耐药细胞株A549/CDDP差异表达的凋亡基因[J].解放军医学杂志,2016(8):645-652.
作者姓名:汪亚君  张海涛  熊禹真  刘彬  伍俊
作者单位:1. 524023广东湛江,广东医科大学附属医院呼吸疾病研究所;2. 524023广东湛江,广东医科大学生物化学与分子生物学教研室
基金项目:广东省社会发展领域科技计划(2014A020212292);广东医科大学博士启动基金(ZY1105;国家自然科学基金青年基金(81400023),This work was supported by the Science and Technology Project of Social Development of Guangdong Province (2014A020212292)
摘    要:目的 应用基因芯片技术筛选曲古菌素A(TSA)处理顺铂耐药肺癌细胞株A549/CDDP后的凋亡相关基因的表达变化,筛选TSA治疗顺铂耐药肺癌的靶分子.方法 TSA处理A549/CDDP细胞24h,以未经TSA处理的A549/CDDP细胞作为对照组,提取两组细胞总RNA并反转录为cDNA,采用NimbleGen全基因组表达芯片检测基因表达情况,以NimbleScan 2.5软件结合GO分析比较TSA处理组与对照组基因表达谱的变化,从差异表达基因中筛选出与凋亡和增殖相关的基因.结果 与对照组相比,共筛选到TSA上调的凋亡相关基因85个以及下调的细胞增殖和生长相关基因43个.GO分析发现,这些基因的分子功能主要是调节细胞凋亡和细胞对化学刺激的抵抗作用,以及参与细胞生长、增殖、细胞生物质量维持等生物过程.TSA不仅激活了线粒体凋亡通路,而且激活了死亡受体相关凋亡通路,下调了与细胞耐药相关的基因BAG3和ABCC2.结论 TSA改变了A549/CDDP细胞中凋亡和增殖基因的表达,这些基因可能在TSA治疗顺铂耐药肺癌中发挥了重要作用.

关 键 词:曲古霉素A  基因芯片  肺肿瘤  抗药性  肿瘤  细胞凋亡

Microarray-based apoptosis gene screening technique in trichostatin A-induced drug-resisted lung cancer A549/CDDP cells
Abstract:
Keywords:trichostatin A  microarray  lung neoplasms  drug resistance  neoplasm  apoptosis
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